Functional MDA5 knockout in CHSE-214 cells decreases the response to long dsRNA and enhances Chum Salmon Reovirus susceptibility
Notice bibliographique
Résumé
Many organisms express sensors that detect long dsRNA, a nucleic acid produced by almost all viruses during replication. These subcellular compartment-specific pattern recognition receptors (PRRs) detect viral replication and rapidly induce a generalist immune response mediated by type I interferon and interferon-stimulated genes (ISGs). In this study, the role of melanoma differentiation-associated protein (MDA)5, a cytoplasmic sensor of long dsRNA, was measured in CHSE-214 cells that have been genetically modified for MDA5 to either to be non-functional (frameshift mutation; MDA5C1) or have a silent point mutation (MDA5C2). These cells were transfected with long dsRNA of either 659bp or 334bp in length, and their ability to induce ISG transcript expression (Mx1, vig-3 and vig-4) was measured by RT-qPCR. MDA5C1 produced significantly less Mx1, vig-3 and vig-4 transcripts compared to MDA5C2 when treated with the 659bp dsRNA molecule, while there was no difference between cell lines in Mx1 expression levels when induced by a 334 bp dsRNA molecule. MDA5C1 was more susceptible to CSV than MDA5C2, and dsRNA treatment was able to protect both cell lines from CSV infection. However, there were no length dependent effects observed, nor were there differences in dsRNA-mediated protection between cell lines. This data suggests that salmonid MDA5 has a length preference similar to mammals, with longer dsRNA molecules being better ligands for this receptor. It also suggests that MDA5 may play a role in the antiviral response against CSV but the antiviral response is not dependent on MDA5. These are important findings for understanding the fundamental importance of MDA5 in the antiviral response of salmonids.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».