The Neurolipid Atlas: a lipidomics resource for neurodegenerative diseases
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Lipid alterations in the brain have been implicated in many neurodegenerative diseases. To facilitate comparative lipidomic research across brain diseases, we establish a data common named the Neurolipid Atlas that we prepopulated with isogenic induced pluripotent stem cell (iPS cell)-derived lipidomics data for different brain diseases. Additionally, the resource contains lipidomics data of human and mouse brain tissue. Leveraging multiple datasets, we demonstrate that iPS cell-derived neurons, microglia and astrocytes exhibit distinct lipid profiles that recapitulate in vivo lipotypes. Notably, the Alzheimer disease (AD) risk gene ApoE4 drives cholesterol ester (CE) accumulation specifically in human astrocytes and we also observe CE accumulation in whole-brain lipidomics from persons with AD. Multiomics interrogation of iPS cell-derived astrocytes revealed that altered cholesterol metabolism has a major role in astrocyte immune pathways such as the immunoproteasome and major histocompatibility complex class I antigen presentation. Our data commons, available online ( https://neurolipidatlas.com/ ), allows for data deposition by the community and provides a user-friendly tool and knowledge base for a better understanding of lipid dyshomeostasis in neurodegenerative diseases.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,002 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle