Predicting the toxicity of chemical compounds via Hyperdimensional Computing
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
ABSTRACT Accurately and efficiently assessing the potential toxicity of chemical compounds is critical given their wide application across pharmaceutical, industrial, and environmental domains. Traditional toxicological evaluations, which predominantly rely on intensive in vitro and in vivo assays, are frequently slow and expensive processes. Here, we introduce a novel application of Hyperdimensional Computing (HDC), an emerging computational paradigm inspired by the way the human brain works in encoding information, for the efficient classification of chemical compounds as either toxic or non-toxic. Our methodology employs Simplified Molecular Input Line Entry System (SMILES) representations of compounds, drawing data from the comprehensive Tox21 dataset. We delineate a pipeline wherein these chemical structures are encoded into high-dimensional binary vectors, which subsequently serve as the foundation for training and classification within the HDC framework. This approach leverages HDC’s inherent advantages, including its resilience to noise, parallel processing capabilities, and efficacy in identifying intricate patterns. This work demonstrates the viability of HDC as a promising alternative for large-scale toxicity prediction, offering a computationally efficient and scalable solution. This research significantly contributes to the field of cheminformatics by validating HDC’s potential in chemical property prediction, thereby facilitating accelerated identification of hazardous substances and mitigating the reliance on intensive laboratory experimentations.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle