MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4414465186 · doi:10.1158/2326-6074.cimm25-a009

Abstract A009: Novel roles of the nuclear autoantigen LEDGF/p75 in modulating prostate cancer related inflammatory pathways and cancer patient response to immunotherapy

2025· article· en· W4414465186 sur OpenAlexaboutno aff
Pedro T. Ochoa, Evelyn S. Sanchez-Hernández, Adelaide Makamure, Janani Nagasubramanya, Sharan Bir, Kai Cheng, Zhong Chen, Issac Kremsky, Charles Wang, Carlos A. Casiano

Notice bibliographique

RevueCancer Immunology Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDownregulation and upregulationProstate cancerCancerGene silencingGene knockdownImmunotherapyTranscription factorAutoantibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract The lens epithelium derived growth factor p75 (LEDGF/p75), encoded by the PSIP1 gene, is a stress oncoprotein that contributes to cancer chemoresistance and tumor aggressiveness through its ability to tether oncogenic transcription factors to active chromatin, promote RNA-loop resolution at transcriptionally active sites, enhance DNA repair, and maintain genomic integrity. Its depletion in prostate cancer (PCa) cells induces genomic instability, which may result in the upregulation of inflammatory gene pathways. LEDGF/p75, also known as the DFS70 nuclear autoantigen, triggers IgG autoantibodies in subsets of healthy individuals, patients with miscellaneous inflammatory conditions, and PCa patients. These autoantibodies have been shown to be associated with lower circulating levels of inflammatory markers. Our recent studies also demonstrated that LEDGF/p75 is upregulated in docetaxel (DTX)-resistant PCa cells and contributes to chemoresistance by regulating gene pathways associated with stress survival, DNA repair, and cell cycle progression. We hypothesized that its silencing in chemoresistant PCa cells may also alter immune-related gene pathways. Knockdown of LEDGF/p75 in chemoresistant PCa cells followed by RNA-seq analysis led to the identification of 970 differentially expressed genes (DEGs). Gene set enrichment analysis (GSEA) revealed a role for LEDGF/p75 in modulating gene pathways associated with lymphocyte and inflammatory responses, since its downregulation led to upregulation of several inflammation-related genes including IL7R, IL18, SWAP70, BMI-1, ULBPI/2, RAET1E/L, TRPM4, FADD, and several MHC class I genes. This suggested that high LEDGF/p75 expression, known to be associated with genomic integrity, may suppress inflammatory responses. Protein expression of these genes was validated by Western blotting in PCa cells with high/low LEDGF/p75 expression. High expression of most of these inflammatory genes also correlated with better overall survival of cancer patients receiving PD-L1, PD-1, or CTLA-4 immunotherapy, as revealed by KM Plotter-Immunotherapy analysis. In addition, publicly available RNA-seq data for various immune cells revealed potential roles of LEDGF/p75 in promoting CD4 and CD8 T cell activation. Further, public scRNA-seq data pointed to LEDGF/p75 expression in T cell clusters for various cancer types. We conclude that as a guardian of genome integrity, LEDGF/p75 contributes to the negative regulation of inflammatory gene pathways. Understanding LEDGF/p75’s roles in cancer immunity and cancer-related autoimmunity may provide new insights into its immunomodulatory functions and its influence on cancer patient response to immunotherapy. Citation Format: Pedro T. Ochoa, Evelyn S. Sanchez-Hernandez, Adelaide Makamure, Janani Nagasubramanya, Sharan Bir, Kai Wen Cheng, Zhong Chen, Issac Kremsky, Charles Wang, Carlos A. Casiano. Novel roles of the nuclear autoantigen LEDGF/p75 in modulating prostate cancer related inflammatory pathways and cancer patient response to immunotherapy [abstract]. In: Proceedings of the AACR Special Conference in Cancer Research: Mechanisms of Cancer Immunity and Cancer-related Autoimmunity; 2025 Sep 24-27; Montreal, QC, Canada. Philadelphia (PA): AACR; Cancer Immunol Res 2025;13(9 Suppl):Abstract nr A009.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,862
Score d'incertitude au seuil0,871

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,345
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueCancer Immunology ResearchMême sujetCancer Immunotherapy and BiomarkersTravaux en français237 207