A single-cell and spatial genomics atlas of human skin fibroblasts reveals shared disease-related fibroblast subtypes across tissues
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Notice bibliographique
Résumé
Abstract Fibroblasts sculpt the architecture and cellular microenvironments of various tissues. Here we constructed a spatially resolved atlas of human skin fibroblasts from healthy skin and 23 skin diseases, with comparison to 14 cross-tissue diseases. We define six major skin fibroblast subtypes in health and three that are disease-specific. We characterize two fibroblast subtypes further as they are conserved across tissues and are immune-related. The first, F3: fibroblastic reticular cell-like fibroblast ( CCL19 + CD74 + HLA-DRA + ), is a fibroblastic reticular cell-like subtype that is predicted to maintain the superficial perivascular immune niche. The second, F6: inflammatory myofibroblasts ( IL11 + MMP1 + CXCL8 + IL7R + ), characterizes early human skin wounds, inflammatory diseases with scarring risk and cancer. F6: inflammatory myofibroblasts were predicted to recruit neutrophils, monocytes and B cells across multiple human tissues. Our study provides a harmonized nomenclature for skin fibroblasts in health and disease, contextualized with cross-tissue findings and clinical skin disease profiles.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle