Multimodal analysis of a rare BARD1 missense variant suggests its pathogenicity is conditional
Notice bibliographique
Résumé
Hereditary breast cancer involves multiple risk genes, including BARD1, which confers low to moderate risk and is associated with triple-negative breast cancer (TNBC). We report a proband with a primary ER+/PR+/HER2- breast cancer, which recurred unilaterally as a TNBC and who later developed endometrial cancer. Clinical germline testing revealed a rare BARD1 missense variant of uncertain significance [c.2258G>T; p.(Gly753Val)]. Whole-exome sequencing of tumors and blood revealed BARD1 loss of heterozygosity and mutational signature 3 - indicative of homologous recombination (HR) repair deficiency - exclusively in the TNBC recurrence. Functional assays demonstrated impaired HR repair via increased PARP inhibitor sensitivity and reduced RAD51 foci formation. We hypothesize that the selective pressure exerted by tamoxifen resulted in breast cancer subtype switching and uncovered the pathogenic potential of the BARD1 p.(Gly753Val) variant. This case illustrates a previously unreported scenario where the pathogenicity of a germline BARD1 variant appears conditional on prior treatment.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».