MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4414485183 · doi:10.1016/j.ajhg.2025.08.012

The Indian Ocean slave trade and colonial expansion resulted in strong sex-biased admixture in South Africa

2025· article· en· W4414485183 sur OpenAlexaff
Austin W. Reynolds, Haiko Schurz, Gillian Meeks, Simon Gravel, Justin W. Myrick, Stacy L. Edington, Fernando L. Méndez, Cedric J. Werely, Paul D. van Helden, Eileen G. Hoal, G. David Poznik, Min-Ju Kim, Caitlin Uren, Peter A. Underhill, Marlo Möller, Brenna M. Henn

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Human Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineSocial Sciences
ThématiqueSex work and related issues
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesNational Institute of General Medical SciencesNational Institutes of HealthSouth African Medical Research CouncilNational Research Foundation
Mots-clésIndigenousColonialismFrontierCapeHaplogroupPopulationEthnic groupIndian ocean

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The colonial-period arrival of Europeans in southern Africa is associated with strong sex-biased migration by which male settlers displaced Indigenous Khoekhoe and San men. Concurrently, the importation of enslaved individuals from South Asia, Indonesia, and eastern Africa likely contributed to female-biased migration. Using genetic data from over 1,400 individuals, we examine the spatial and temporal spread of sex-biased migration from the Cape to the northern edges of the historic colonial frontier. In all regions, admixture patterns were sex biased, with evidence of a greater male contribution of European ancestry and greater female contribution of Khoe-San ancestry. While admixture among Khoe-San, European, equatorial African, and Asian groups has likely been continuous from the founding of Cape Town to the present day, we find that Khoe-San groups further north experienced a single pulse of European admixture 6-8 generations ago. European admixture was followed by additional Khoe-San gene flow, potentially reflecting an aggregation of Indigenous groups due to disruption by colonial interlopers. Male migration into the northern frontier territories was not a homogenous group of expanding Afrikaners and slaves. The Nama exhibit distinct founder effects and derive 15% of their Y chromosome haplogroups from Asian lineages, a pattern absent in the ≠Khomani San. Khoe-San ancestry from the paternal line is greatly diminished in populations from Cape Town, the Cederberg Mountains, and Upington but remains more frequent in self-identified Indigenous ethnic groups. Strikingly, we estimate that Khoe-San Y chromosomes were experiencing unprecedented population growth at the time of European arrival. Our findings shed light on the patterns of admixture and population history of South Africa as the colonial frontier expanded.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,019
Score d'incertitude au seuil0,039

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,287 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueThe American Journal of Human GeneticsMême sujetSex work and related issuesTravaux en français237 207