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Enregistrement W4414498837 · doi:10.1101/2025.09.23.25336398

Disentangling osteoarthritis-specific genetic effects from obesity to identify novel therapeutic targets

2025· preprint· en· W4414498837 sur OpenAlexafffund
Chen‐Yang Su, Masashi Hasebe, Dandan Tan, Kevin Y. H. Liang, Takayoshi Sasako, Vincent Mooser, Wenmin Zhang, Sirui Zhou, Satoshi Yoshiji, Tianyuan Lu, Guillaume Butler‐Laporte

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCytokine Signaling Pathways and Interactions
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésMendelian randomizationGenome-wide association studyGenetic associationGenetic variationQuantitative trait locusProteomicsExpression quantitative trait lociCandidate gene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Osteoarthritis (OA) significantly impairs mobility and quality of life for hundreds of millions of individuals. Given the limited non-surgical treatment options for OA, genetics may help identify new strategies for treatment. However, many genetic associations with OA arise from its genetic correlation with obesity (measured by body mass index [BMI]), which makes it difficult to find OA-specific genetic associations. This study used a genome-wide association study (GWAS)-by-subtraction approach to separate genetic effects specific to OA from those shared with BMI, using GWAS of 12 OA traits from the Genetics of Osteoarthritis Consortium. Subsequent proteome-wide Mendelian randomization and colocalization analyses across four large proteomics cohorts identified 27 candidate causal proteins influencing OA via pathways not fully mediated by BMI. Among these, extracellular matrix and bone remodeling mediators such as COL6A2, SMAD3, SPP1, and TNFSF11 (RANKL) were highlighted as promising therapeutic targets. Colocalization with expression quantitative trait loci in osteoclasts and other relevant tissues provided additional biological support. Further, actionability assessments identified several proteins already targeted by existing therapies, such as the approved TNFSF11 (RANKL) inhibitor, denosumab, suggesting repurposing opportunities to modulate subchondral bone turnover in OA. This integrative proteogenomic framework clarifies biological mechanisms of OA beyond BMI-related pathways and offers potential targets for intervention.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,591
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,315
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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