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Enregistrement W4414499256 · doi:10.1093/jleuko/qiaf136

GATA2 induces a stem cell–like transcriptional program in macrophages that promotes an atherogenic phenotype

2025· article· en· W4414499256 sur OpenAlexafffund
Amena Aktar, Angela M. Vrieze, Kiera Telesnicki, Paisley Cox‐Duvall, Matthew Arbolino, Rodney P. DeKoter, A. Dave Nagpal, Bryan Heit

Notice bibliographique

RevueJournal of Leukocyte Biology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmune cells in cancer
Établissements canadiensLondon Health Sciences CentreRobarts Clinical TrialsWestern University
Organismes subventionnairesWestern UniversityHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésGATA2Transcription factorHaematopoiesisIRF8Foam cellDownregulation and upregulationEfferocytosisRUNX1PhenotypeMacrophage

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Atherosclerosis is a chronic inflammatory disease characterized by the accumulation of lipid-laden necrotic macrophages within blood vessels walls. GATA2 is a normally hematopoietic transcription factor which in the bone marrow helps maintain the proliferative, nondifferentiated phenotype of hematopoietic progenitors. Unexpectedly, GATA2 is upregulated in macrophages within atherosclerotic plaque, where it plays an unknown role in disease progression. Although GATA2 can be expressed from 2 promoters, we determined that the atherogenic stimuli oxidized low-density lipoprotein and tumor necrosis factor α induce GATA2 expression via the internal (IG) GATA2 promoter, with GATA2 transcription initiated by the transcription factors NF-κB, STAT1, and the aryl hydrocarbon receptor. GATA2 had a divergent effect on promoter activity, with GATA2 upregulating genes associated with stem cell maintenance, hematopoiesis, proliferation, reactive oxygen species production, and migration, while downregulating genes central to macrophage function including those for cholesterol efflux, pathogen phagocytosis, and the efferocytosis of apoptotic cells. Consequentially, GATA2-expressing macrophages had a proatherogenic phenotype typified by highly motile cells exhibiting poor cholesterol efflux and impaired phagocytosis and efferocytosis. These results indicate that GATA2 upregulation induces an immature, stem cell-like phenotype in atheroma macrophages, that may promote plaque cellularity while compromising atheroprotective mechanisms such as cholesterol clearance and apoptotic cell removal.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,291
Écart entre enseignants0,267 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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