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Enregistrement W4414512236 · doi:10.3390/ijms26199364

Transcriptional Regulation of WTAP Isoforms by NF-κB Signaling in Human Monocytes

2025· article· en· W4414512236 sur OpenAlexfundno aff
Lucas W. Picavet, Hisham I Abu-Tawil, Lyanne J. P. M. Sijbers, Jorg J. A. Calis, Nienke M. ter Haar, Alejandra Bodelόn, Sebastiaan J. Vastert, Jorg van Loosdregt

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Molecular Sciences · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA modifications and cancer
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesArthritis SocietyReumaNederlandDutch Arthritis Society
Mots-clésGene isoformInnate immune systemTranscription factorRegulation of gene expressionImmune systemGene expressionTranscriptional regulationSignal transductionDownregulation and upregulation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

N6-methyladenosine (m6A) is a dynamic RNA modification that critically modulates gene expression in immune responses. While m6A regulators such as WTAP are implicated in inflammatory and autoimmune diseases, the mechanisms governing their expression during innate immune activation remain unclear. Here, we demonstrate that WTAP expression in human CD14+ monocytes is upregulated upon lipopolysaccharide (LPS) stimulation and is associated with alternative promoter usage leading to distinct mRNA isoforms. Bioinformatic analysis and pharmacological inhibition reveal that the transcription factor RELA (NF-κB pathway) directly contributes to this promoter-specific induction. Functional analyses show that both WTAP isoforms encode identical proteins, indicating transcriptional, rather than post-transcriptional, regulation. These findings uncover a novel NF-κB-dependent mechanism regulating WTAP isoform expression in activated monocytes, providing insight into the epitranscriptomic modulation of inflammation and potential dysregulation in autoimmune disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,304
Écart entre enseignants0,292 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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