MétaCan
Menu
← Retour à la cohorte
Enregistrement W4414514026 · doi:10.1038/s41467-025-63465-4

Oncogenic driver mutations underlie the spatial tumour immune landscape of non-small cell lung cancer

2025· article· en· W4414514026 sur OpenAlexafffund
Saskia Hartner, Hanie Abolfathi, Morteza Rezanejad, Bridget Liu, Elham Karimi, Dakota Rogers, Mark Sorin, Samuel Doré, Lysanne Desharnais, Michèle Orain, William Enlow, Andréanne Gagné, Yuhong Wei, Yohan Bossé, Daniela F. Quail, Philippe Joubert, Logan A. Walsh

Notice bibliographique

RevueNature Communications · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCancer Immunotherapy and Biomarkers
Établissements canadiensMcGill Genome CentreUniversité LavalInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de QuébecMcGill UniversityMcGill University Health Centre
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchInstitut universitaire de cardiologie et de pneumologie de Québec, Université LavalFonds de Recherche du Québec - SantéQuébec Consortium for Drug DiscoveryMcGill University
Mots-clésKRASLung cancerMutationImmune systemAdenocarcinomaTumor microenvironmentCancerTumour heterogeneityGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Lung adenocarcinoma (LUAD) is a molecularly diverse form of lung cancer characterized by distinct oncogenic driver mutations that influence both tumour biology and clinical outcomes. Understanding the interplay between these oncogenic drivers and the tumour microenvironment (TME) is crucial for improving therapeutic strategies and patient management. Here, we investigate the impact of driver mutations on the composition and spatial architecture of the TME in LUAD. Using imaging mass cytometry (IMC), we analyse tumour samples from 157 LUAD patients, integrating genomic and clinical data to link specific mutations with tumour characteristics. Unique patterns are associated with mutated KRAS and EGFR tumours with TP53 co-mutations, suggesting these co-mutations reshape the TME and promote resistance to tyrosine kinase inhibitors (TKIs). Overall, our findings highlight the complex interplay between oncogenic driver mutations and the TME in LUAD, underscoring the importance of integrating genomic and cellular data to understand the underlying tumour behaviour and prognosis. Oncogenic driver mutations can influence the tumour biology of lung adenocarcinomas. Here, authors analyse 157 LUAD samples using imaging mass cytometry to reveal how these mutations impact the tumour microenvironment and clinical outcomes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,309
Écart entre enseignants0,298 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations6
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueNature Communications→Même sujetCancer Immunotherapy and Biomarkers→Travaux en français237 207→