Age-related reproductive performance and transcriptome profiling of testis in male blue catfish, Ictalurus furcatus
Notice bibliographique
Résumé
Catfish farming is the largest aquaculture industry in the U.S., where hybrid catfish produced by channel catfish, Ictalurus punctatus ♀ × blue catfish, I. furcatus ♂, represent > 50% of the harvest. Previous studies indicated a high degree of variation in reproductive performance among individuals. Therefore, it is crucial to establish a connection between paternal age and reproductive success. This study investigated the reproduction of 103 blue catfish males aged 2 to 10 years. Morphometric data were collected, and blood was drawn to quantify testosterone (T), 11-ketotestosterone (11-KT), osmolality, and ions. Histological images of the testis assessed stages of spermatogenesis, and sperm were activated for kinematic analysis. The testis transcriptome was profiled across distinct ages, 2, 4, 7, and 9. For fish aged 2 to 10 years, those over 7 years had the largest size, with a rapid increase until age 7 and a slight increase afterwards. Absolute sperm production was affected by age, with the highest levels observed at age 6, followed by a decreasing trend. T and 11-KT did not increase after age 6, while sperm kinematics were not impacted by age. Transcriptomics identified 5220 differentially expressed genes (DEGs) in all comparisons. The most DEGs were identified at age 7 with 2261 down-regulated and 1824 up-regulated genes. Functional enrichment revealed significant changes in axoneme, motile cilium, and sperm flagellum at age 7. In contrast, immune processes were increased in the testis at age 9 with viral and bacterial defense responses. Results suggest that farmers should maintain consistent supplies of age 6 and 7 males to increase hatchery efficiency.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».