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Enregistrement W4414532519 · doi:10.1101/2025.09.18.677249

Probing the activity of cysteine cathepsins in inflammatory bowel diseases

2025· preprint· en· W4414532519 sur OpenAlexaff
Bethany M. Anderson, A. Ziegler, Rhiannon I. Campden, Hongyi Wu, Bangyan Xu, Rachel M. McQuade, Simona Carbone, Daniel P. Poole, Alan Lomax, David E. Reed, Stephen Vanner, Robin M. Yates, Nigel W. Bunnett, Laura E. Edgington‐Mitchell

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueBone and Dental Protein Studies
Établissements canadiensQueen's UniversityUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilNational Institutes of HealthNational Health and Medical Research CouncilU.S. Department of Defense
Mots-clésCathepsinCathepsin SCathepsin LCathepsin L1Cathepsin BCathepsin CColitisCathepsin ECathepsin A

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Cathepsin S is a cysteine protease that has been implicated in inflammatory bowel diseases (IBD) for its ability to promote visceral pain. Given its pro-inflammatory roles, we hypothesized that cathepsin S would drive other symptoms associated with IBD. Using activity-based probes, we investigated cysteine cathepsin activation in human and murine colitis. We observed a significant increase in fecal cathepsin S in patients with ulcerative colitis compared to healthy controls, while cathepsin S in mucosal biopsies was unchanged. Mice with experimental colitis exhibited a modest increase in mucosal activity of both cathepsin S and X compared to naïve mice. Luminal secretion of cathepsin S was dramatically increased upon colitis induction, although differences between mouse colonies were observed. To investigate the contribution of cathepsin S and cathepsin X to colitis, we induced colitis in cathepsin-deficient mice. Cathepsin X-deficient mice exhibited no clear differences in disease indicators compared to wild-type mice. While cathepsin S-deficient mice exhibited less rectal bleeding, less splenomegaly and marginally improved histological scores, weight loss, diarrhea, colon shortening, and myeloperoxidase activity were not significantly different from wild-type mice. To determine whether pharmacologic inhibition of cathepsin S activity would ameliorate symptoms of colitis, a reversible inhibitor LY3000328 was administered to mice at the initiation of colitis. LY3000328 provoked a clear upregulation of cathepsin S and L activity in the mucosa, most likely through a compensatory mechanism. This increase in protease activity was associated with exacerbated histological scores and splenomegaly. Collectively, these results suggest that cathepsin S, but not cathepsin X, may contribute to some of the symptoms of experimental colitis. While cathepsin S has potential to be a therapeutic target in colitis, improved strategies to sustain its inhibition are required in future.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,238
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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