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Enregistrement W4414536975 · doi:10.1101/2025.09.24.678341

Induced pathogenicity toward open-ocean diatoms by a newly isolated filterable bacterium <i>Ekhidna algicida</i> sp. nov.

2025· preprint· en· W4414536975 sur OpenAlexaff
Shiri Graff van Creveld, Sacha Coesel, Ellen Lavoie, Vaughn Iverson, Rhonda Morales, Megan J. Schatz, Alexandra E. Jones-Kellett, Jesse McNichol, R. M. Key, Jed A. Fuhrman, Bryndan P. Durham, E. Virginia Armbrust

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMaterials Science
ThématiqueDiatoms and Algae Research
Établissements canadiensSt. Francis Xavier University
Organismes subventionnairesNational Science Foundation
Mots-clésAxenicBacteriaMarine bacteriophagePhytoplanktonPelagic zoneDiatomPathogenStrain (injury)Pacific ocean

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Phytoplankton are the base of marine food webs. They form intricate interactions with heterotrophic bacteria ranging from mutualistic to pathogenic that together impact oceanic carbon and nutrient cycling. Our understanding of these interactions in marine environments remains primarily limited to laboratory-based studies of model organisms. Here, we report the discovery and characterization of Ekhidna algicida sp. nov. strain To15, isolated from the oligotrophic Pacific Ocean (16°N, 140°W) based on its algicidal effect on the pelagic diatom Thalassiosira oceanica . Subsequent co-culture experiments demonstrate that E. algicida is lethal within days to a diverse array of diatoms, with the effect mediated by bacterial exudates that remain algicidal on their own against axenic T. oceanica cultures. Twenty additional algicidal Ekhidna strains were subsequently isolated from the Pacific Ocean. Our findings reveal E. algicida as a potentially widespread pathogen of diatoms, that can alter microbial community composition dynamics in pelagic ecosystems. Teaser A newly discovered Pacific Ocean bacterium can kill diatoms, revealing a hidden pathogenic role in open-ocean ecosystems.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Communication savante
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,016
Score d'incertitude au seuil0,999

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0020,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0030,001
Science ouverte0,0040,006
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,021
Tête enseignante GPT0,254
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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