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Enregistrement W4414555061 · doi:10.3390/arm93050039

NSCLC EGFR Mutation Prediction via Random Forest Model: A Clinical–CT–Radiomics Integration Approach

2025· article· en· W4414555061 sur OpenAlexaff
Anass Benfares, Badreeddine Alami, Sara Boukansa, Mamoun Qjidaa, Ikram Benomar, M. Serraj, Ahmed Lakhssassi, Mohammed Ouazzani Jamil, Mustapha Maâroufi, Hassan Qjidaa

Notice bibliographique

RevueAdvances in respiratory medicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueRadiomics and Machine Learning in Medical Imaging
Établissements canadiensUniversité du Québec en Outaouais
Organismes subventionnairesUniversité Hassan II de Casablanca
Mots-clésRandom forestEpidermal growth factor receptorFeature selectionGenotypingLung cancerMutationPrecision and recallFeature (linguistics)Cohort

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Non-small cell lung cancer (NSCLC) is the leading cause of cancer-related mortality worldwide. Accurate determination of epidermal growth factor receptor (EGFR) mutation status is essential for selecting patients eligible for tyrosine kinase inhibitors (TKIs). However, invasive genotyping is often limited by tissue accessibility and sample quality. This study presents a non-invasive machine learning model combining clinical data, CT morphological features, and radiomic descriptors to predict EGFR mutation status. A retrospective cohort of 138 patients with confirmed EGFR status and pre-treatment CT scans was analyzed. Radiomic features were extracted with PyRadiomics, and feature selection applied mutual information, Spearman correlation, and wrapper-based methods. Five Random Forest models were trained with different feature sets. The best-performing model, based on 11 selected variables, achieved an AUC of 0.91 (95% CI: 0.81-1.00) under stratified five-fold cross-validation, with an accuracy of 0.88 ± 0.03. Subgroup analysis showed that EGFR-WT had a performance of precision 0.93 ± 0.04, recall 0.92 ± 0.03, F1-score 0.91 ± 0.02, and EGFR-Mutant had a performance of precision 0.76 ± 0.05, recall 0.71 ± 0.05, F1-score 0.68 ± 0.04. SHapley Additive exPlanations (SHAP) analysis identified tobacco use, enhancement pattern, and gray-level-zone entropy as key predictors. Decision curve analysis confirmed clinical utility, supporting its role as a non-invasive tool for EGFR-screening.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,003
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,891
Score d'incertitude au seuil0,908

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0030,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,375
Écart entre enseignants0,351 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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