Clinical and Molecular Profiling of Colorectal Cancer: A Comprehensive Cohort Study of BRAF-Mutated Cases from a Tertiary Centre
Notice bibliographique
Résumé
Introduction: Increasingly, identification of BRAF mutation in colorectal cancer is used to guide management and predict cancer behaviour. There is, however, still significant diversity within this cohort of patients, both in terms of clinical phenotype and treatment outcomes. This may be explained, at least in part, by differences between classes of BRAF mutations and the presence of concomitant mutations. Methods: We present a retrospective cohort study of sequential patients diagnosed with BRAF-mutated (V600 and non-V600) colorectal cancer between 2014 and 2022. Information regarding presentation, treatment outcomes and molecular subtype was identified using the electronic medical record. Results: This study included 406 patients with BRAF-mutated colorectal cancer, 253 (228 V600BRAF) of whom had localised disease and 153 (137 V600BRAF) with metastatic disease at the time of diagnosis. In patients with localised disease at diagnosis, the V600BRAF mutation was associated with older median age (73 vs. 63 years, p = 0.04) and a higher prevalence of right-sided primary (73% vs. 40%, p < 0.01), mismatch repair deficiency (56% vs. 8%, p < 0.01), and faster time to disease relapse (p = 0.006). In the metastatic setting, non-V600BRAF mutation was associated with a higher prevalence of KRAS mutation (27% vs. 1%, p < 0.01), NRAS mutation (14% vs. 3%, p = 0.04) and PIK3CA mutation (33% vs. 8%, p = 0.02). Mismatch repair deficiency was more common in patients with V600BRAF mutations than in those with non-V600BRAF mutations (20% vs. 0%, p = 0.01). The median survival of patients with the V600BRAF mutation was 14 months, and 34 months in those with non-V600BRAF mutations. Concomitant RNF43 mutation in metastatic disease, was associated with a significantly higher incidence of disease control from combined BRAF and EGFR inhibition, when compared to those without an RNF43 mutation (100% vs. 54%, p = 0.02). Conclusions: Presentation and outcomes of BRAF-mutated colorectal cancer are heterogenous. The type of BRAF mutation, and the presence of concomitant RNF43 mutation, may explain some of the differences in cancer behaviour. Routine reporting of RNF43 mutations would assist clinicians to give more personalised treatment recommendations.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,003 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,002 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».