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Enregistrement W4414569487 · doi:10.1016/j.etap.2025.104828

Unveiling the molecular responses of human lung cells to retene: Transcriptomics insights and implications for toxicity

2025· article· en· W4414569487 sur OpenAlexafffund
Francisco Carlos da Silva, Junyi Lin, Markus Hecker, Sílvia Regina Batistuzzo de Medeiros

Notice bibliographique

RevueEnvironmental Toxicology and Pharmacology · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicroRNA in disease regulation
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesConselho Nacional de Desenvolvimento Científico e TecnológicoNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCoordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível SuperiorCanada Research Chairs
Mots-clésTranscriptomeHormesisCellmicroRNACell growthPhenotypeExtracellular matrixMitochondrionCell metabolismExtracellular

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

While retene (RET) ecotoxicity has been studied, its molecular mechanisms remain unclear despite its prevalence in forest fires. This study investigated RET's effects in BEAS-2B cells using whole transcriptome (RNA-seq) analysis, cell viability, ATP level, cell adhesion, cell migration, and cell invasiveness endpoints after 24 h and 72 h of exposure. RNA-seq revealed dynamic transcriptional changes, including dysregulated long non-coding RNAs (lncRNAs), microRNAs (miRNAs), and pseudogenes. Pathway analysis implicated disrupted fatty acid metabolism and mitochondrial function, suggesting energy imbalance. RET induced hormesis effects, with low doses stimulating cell proliferation and increase in ATP levels. Altered cytoskeletal and extracellular matrix genes likely drove enhanced adhesion, migration, and invasiveness. Wound healing and transwell assays suggested RET may promote epithelial-mesenchymal transition-like functional phenotype (EMT). The present findings suggested metabolic adaptation and transcriptional regulation as key to RET's effects on proliferation and invasiveness, revealing complex cellular responses to environmental stressors with implications for PAH-linked respiratory diseases and carcinogenesis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,293
Écart entre enseignants0,284 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentnon

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