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Enregistrement W4414573207 · doi:10.1016/j.nbd.2025.107126

Human iPSC-derived glutamatergic neurons with pathogenic KCNQ2 variants display hyperactive bursting phenotypes

2025· article· en· W4414573207 sur OpenAlexaff
Maria Sundberg, Carole Shum, Erika M. Norabuena, Nina R. Makhortova, Cidi Chen, Leilei Yu, Kristina Kim, Sang Yeon Han, Jennifer Howe, Annapurna Poduri, Elizabeth D. Buttermore, Stephen W. Scherer, Mustafa Çağlar Şahin

Notice bibliographique

RevueNeurobiology of Disease · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesEunice Kennedy Shriver National Institute of Child Health and Human Development
Mots-clésInduced pluripotent stem cellPhenotypeBurstingGlutamatergicNeuriteMultielectrode arrayPremovement neuronal activityPotassium channelPhenotypic screening

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pathogenic variants in the KCNQ2 gene, which encodes a potassium channel subunit, are associated with neonatal seizures, epileptic encephalopathy, intellectual disability, and autism. Although the consequences of disrupted KCNQ2 channel function have been studied in the past, the detailed molecular mechanisms underlying the development of neurological phenotypes remain unclear, and neuronal models of specific patient variants are lacking. We generated patient-specific induced pluripotent stem cells (iPSCs) from fibroblasts from three individuals with distinct KCNQ2 pathogenic variants. We corrected the KCNQ2 variants using CRISPR-Cas9 editing to create isogenic controls and differentiated these iPSCs into glutamatergic neurons to study the effects of each variant on neuronal function. The three KCNQ2 variants were: 1) KCNQ2 c.875_877delTCCinsCCT, L292_L293delinsPF, 2) KCNQ2 c.766G > T, G256W, and 3) KCNQ2 c.821C > T, T274M. Our data revealed longer neurite outgrowth in two patient lines (T274M and G256W). Transcriptional profiling showed that all three KCNQ2 lines co-expressed genes enriched in synaptic transmission/signaling, cell adhesion, and GTPase signal transduction. Functional analyses of neuronal networks revealed increased burst duration in all three KCNQ2 lines compared with their isogenic controls. Furthermore, neurons from the L292_L293delinsPF and T274M lines displayed increased network connectivity associated with increased density of synaptic markers. Finally, we detected hyperexcitable neuronal networks in the G256W line with electrical stimulation of the neural networks on a high-density microelectrode array, and this phenotype was rescued with retigabine. These disease-related phenotypes for each of the KCNQ2 pathogenic variants can be used for drug screening to identify treatment options for the patients.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,240
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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