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Enregistrement W4414576012 · doi:10.1101/2025.09.27.678972

Designing a robust whole-cell biosensor for detection of toxic metals using intein splicing inhibition of <i>Mycobacterium tuberculosis</i> SufB protein

2025· preprint· en· W4414576012 sur OpenAlexaff
Ashwaria Mehra, Ananya Nanda, Sasmita Nayak

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
Thématiquebioluminescence and chemiluminescence research
Établissements canadiensToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiosensorMetal ions in aqueous solutionInteinRNA splicingMetalProtein splicingAbsorbance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Disruption of the natural geochemical cycle by human activities has led to bioaccumulation of metals, posing a global health threat. Hence, there is a pressing need for simple, sensitive, yet eco-friendly biosensor setups to monitor metal contamination in the environment. Existing biosensors are limited by poor efficiency, stability issues, and complex instrumentation requiring skilled operators. To address these caveats, current study explores how intein-mediated protein splicing, a spontaneous post-translational process, can be adapted for metal-biosensing by coupling metal-dependent splicing inhibition to viability loss of native microbial cells. Toxic metal ions like Cd 2₊ and Hg 2₊ attenuated the splicing activity of Mtb SufB precursor protein over a concentration range of 25 µM to 2 mM, while Pb 2₊ and Cr 3₊ failed to do so. An innovative biosensor platform was designed for colorimetric detection of metal ions via simple Alamar Blue assay, where attenuated Mtb strain (H37Ra) served as the indicator cells. Metal-induced SufB splicing inhibition led to loss of viability of H37Ra cells, while addition of metal-specific chelators reversed the effect. Multiplexing ability was evaluated by including known splicing inhibitors like Cu 2₊ , Zn 2₊ , and Pt 4₊ over various concentration range alongside Cd 2₊ and Hg 2₊ . The simple 96-well plate format enables multiplexed qualitative metal detection, while colorimetric absorbance measurement ensures metal quantification. The designed biosensor offers low-cost, user-friendly, and sensitive assay for high-throughput metal detection, utilizing whole-cell native organisms carrying metal-sensing precursor protein. Thus, this approach can be implemented in standard biological laboratories for robust metal screening process in environmental and industrial effluents.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,223 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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