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Enregistrement W4414576534 · doi:10.1101/2025.09.25.678511

Evolutionary rescue accelerates competitive exclusion in a parasite community

2025· preprint· en· W4414576534 sur OpenAlexafffund
Samuel T. E. Greenrod, Daniel Cazares, Weronika A Slesak, Tobias E. Hector, R. Craig MacLean, Kayla C. King

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEvolution and Genetic Dynamics
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNatural Environment Research CouncilNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésExtinction (optical mineralogy)Adaptation (eye)BiodiversityCompetition (biology)Host (biology)Experimental evolutionGenetic diversityGenetic Fitness

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Environmental stress drives biodiversity loss by altering competitive hierarchies and pushing taxa towards extinction. Parasites and their communities are particularly vulnerable to stress due to environmental sensitivity of infection steps, variation in species tolerance during co-infections, and dependence on host fitness. Parasite populations might avoid extinction through evolutionary rescue – whereby rapid adaptation to stress enables persistence – but whether this process can preserve community diversity remains unclear. Here, we study the impact of evolutionary rescue in a simple parasite community by propagating populations of two viral parasites (bacteriophages ϕ14-1 and ϕLUZ19) of Pseudomonas aeruginosa in monoculture and co-culture under two thermal conditions, a control temperature (37°C) and a high temperature that restricts ϕ14-1 growth (42°C). We show that evolutionary rescue of ϕ14-1 prevented extinction in monoculture. Rescue of this phage in co-culture made it a superior competitor, and it replaced ϕLUZ19 as the dominant phage at high temperature. We determine that evolutionary rescue occurred through mutations in genes linked to attachment to bacterial hosts and within-host replication. We also show that competitive suppression by ϕ14-1 constrained ϕLUZ19 molecular evolution. Our findings suggest that evolutionary rescue can prevent the extinction of some parasites, but may inadvertently destabilise the community and facilitate further biodiversity loss. This work underscores the need to take an eco-evolutionary approach to predict the responses of communities to global climate change.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,250
Écart entre enseignants0,237 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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