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Enregistrement W4414577409 · doi:10.1101/2025.09.23.678005

Senataxin is required for optimal class switch recombination to the immunoglobulin A isotype

2025· preprint· en· W4414577409 sur OpenAlexafffund
Vithushan Surendran, Jonathan Mapletoft, Peter YF. Zeng, Julia Avolio, Sam Afkhami, Joshua J.C. McGrath, Andrew T. Chen, Art Marzok, Jann C. Ang, Kyle Amaral, Yona Tugg, Martin R. Stämpfli, Matthew S. Miller

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueImmunodeficiency and Autoimmune Disorders
Établissements canadiensWestern UniversityMcMaster UniversityMcMaster University Medical Centre
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUniversity of QueenslandMcMaster University
Mots-clésImmunoglobulin class switchingIsotypeImmune systemAntibodyB cellGeneAntigenGerminal centerHomologous recombination

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Senataxin (SETX) is an RNA/DNA helicase that plays a pivotal role in transcription, R-loop resolution, and the DNA damage response (DDR). Dysfunction of SETX, however, has been implicated in neurodegenerative diseases, including amyotrophic lateral sclerosis and ataxia with oculomotor apraxia type 2. Importantly, both R-loop resolution and the DDR are essential for class switch recombination (CSR) in B cells, a critical step in generating antibody diversity. Here we demonstrate that ex vivo polyclonal stimulation of SETX +/+ and SETX -/- mouse splenocytes results in equivalent amounts of IgM- and IgG-secreting B cells but significantly fewer IgA-producing B cells in SETX -/- mice. Additionally, SETX -/- mice generate significantly reduced antigen specific IgA titers following infection with influenza A virus. Sequencing of the IgA-secreting B cell repertoire revealed reduced clonal diversity in SETX -/- mice. SETX -/- mice also had increased R-loop formation within the IgA locus. Collectively, these data highlight an important role for SETX in mediating CSR to IgA. As such, a further understanding of SETX’s role in the immune response is important for expanding our knowledge of both the general immunobiology relating to CSR as well as the immunological phenotypes associated with neurodegenerative diseases associate with mutations in SETX.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,576
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0010,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0020,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,013
Tête enseignante GPT0,234
Écart entre enseignants0,222 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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