<i>Petrotogaceae</i>
Notice bibliographique
Résumé
Abstract Pe.tro.to.ga'ce.ae. N.L. fem. n. Petrotoga , type genus of the family; L. fem. pl. n. suff. ‐aceae , ending to denote a family; N.L. fem. pl. n. Petrotogaceae , the family whose nomenclatural type is the genus Petrotoga . The family Petrotogaceae , the only family in the order Petrotogales , comprises mesophilic and thermophilic bacteria, which grow optimally at salinities that range from freshwater to sea water. The family currently accommodates six genera: Defluviitoga , Geotoga , Marinitoga , Oceanotoga , Petrotoga , and Tepiditoga . Several 16S rRNA sequences and metagenomes from environmental samples suggest that Petrotogaceae may include additional genera whose representatives are not yet isolated. The cells are sheathed rods that can form chains. The cells stain Gram‐negative. Members of this family are heterotrophs and anaerobes. Sulfur is reduced by all the type strains of the six genera. Thiosulfate is reduced by the members of the genera Defluviitoga , Geotoga , Oceanotoga , and Tepiditoga . Known habitats are shallow and deep‐sea hydrothermal vents, terrestrial hot springs, oils and gas reservoirs, and human‐made environments, such as biogas reactors, landfills, and wastewater. DNA G + C content (mol%) : 25.8–34.1 (genome analysis). Type genus : Petrotoga Davey et al. 1993, VL47. Taxonomic and Nomenclature Notes According to the List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), the taxonomic status of the family Petrotogaceae is: correct name (last update, April 2026) * . LPSN classification: Bacteria / Thermotogati / Thermotogota / Thermotogae / Petrotogales / Petrotogaceae The family Petrotogaceae can also be recovered in the Genome Taxonomy Database (GTDB) as f__Petrotogaceae (version v232) ** . GTDB classification: d__Bacteria / p__Thermotogota / c__Thermotogae / o__Petrotogales / f__Petrotogaceae * Freese , H.M. , Meier‐Kolthoff , J.P. , Sardà Carbasse , J. , Afolayan , A.O. , Göker , M. ( 2026 ). TYGS and LPSN in 2025: a Global Core Biodata Resource for genome‐based classification and nomenclature of prokaryotes within DSMZ Digital Diversity. Nucleic Acids Res , 54 (), D884 – D891 ; doi: 10.1093/nar/gkaf1110 **
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,001 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,109 | 0,059 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».