Sibling species differently distributed around a CO2 vent show transplantation proteomic remodelling, while displaying metabolomic signatures associated with their origin
Notice bibliographique
Résumé
Abstract The cellular homeostatic response (CHR) and cellular stress response (CSR) work together to maintain homeostasis. Studying phylogenetically closely-related species inhabiting different environments can help investigate the interplay between the CHR and CSR. We conducted reciprocal in situ transplant experiments in a natural CO2 vent (Ischia, Italy), using the sibling annelid species Platynereis cf.. dumerilii and Platynereis cf.. massiliensis which have been shown to have different preferential distributions around the CO2 vent. Following transplantations, we characterised the response of each individual’s proteome, metabolome, and lipidome, to short or long-term exposure to different pCO2 regimes (i.e., high and low), and confirmed its genetic identity. Here we show that different components of the CHR and CSR are utilised at different rates when Platynereis spp. are exposed to different pCO2 regimes, with cellular responses shown to be conserved across species. Metabolome and lipidome responses were dependent on regime of origin, and changed relatively slowly, whereas proteome responses were dependent on transplant type and changed more rapidly. Our results provide new insights to improve our understanding of the interplay between different cellular physiological responses involved in defining the functional phenotype of marine species, and their ability to acclimatise to future projected high pCO2 conditions.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».