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Enregistrement W4414598167 · doi:10.1101/2025.09.09.25335269

A Deep Autoencoder for Fast Spectral-Temporal Fitting of Dynamic Deuterium Metabolic Imaging Data at 7T

2025· preprint· en· W4414598167 sur OpenAlexaff
Aaron Osburg, Amirmohammad Shamaei, Bernhard Strasser, Fabian Niess, Anna Duguid, Viola Bader, S.D. Frese, Lukas Hingerl, Hauke Fischer, William T. Clarke, Georg Langs, Wolfgang Bogner, Stanislav Motyka

Notice bibliographique

RevuemedRxiv · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdvanced MRI Techniques and Applications
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesAustrian Science FundEuropean CommissionBundesministerium für Digitalisierung und WirtschaftsstandortÖsterreichische Nationalstiftung für Forschung, Technologie und Entwicklung
Mots-clésParametric statisticsSimilarity (geometry)AutoencoderMetaboliteParametric modelDistortion (music)Mean squared errorMatching (statistics)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Deuterium metabolic imaging (DMI) is a non-invasive magnetic resonance spectroscopic imaging technique enabling in vivo mapping of glucose metabolism. Dynamic DMI provides time-resolved metabolite maps and allows spatially resolved fitting of metabolic models to capture metabolite concentration dynamics. However, conventional fitting tools often require long processing times for high-resolution datasets, limiting their practical utility. To address this bottleneck, we propose a deep autoencoder (DAE) for rapid spectral-temporal fitting of dynamic DMI data, supporting arbitrary parametric model constraints to describe metabolite concentration dynamics. The DAE was benchmarked against spectral-temporal fitting using FSL-MRS and LCModel. Fitting accuracy was evaluated on in vivo and synthetic whole-brain dynamic DMI data acquired at 7T using Bland-Altman metrics, Pearson correlation coefficients, structural similarity index measures, and root mean squared errors for both metabolite concentrations and model constraint parameters. The DAE achieved processing times of 0.29 ms per voxel, corresponding to an acceleration of more than three orders of magnitude compared to LCModel/FSL-MRS (0.55 s/0.65 s per voxel). On in vivo data, it showed excellent agreement with LCModel, and on synthetic data, it consistently outperformed both reference methods across all evaluation metrics. The proposed DAE enables accurate spectral-temporal fitting for whole-brain dynamic DMI scans within less than a second, matching or exceeding the performance of conventional state-of-the-art fitting methods. This makes it a promising tool for integration into efficient post-processing pipelines for research and clinical DMI workflows.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,007
Score d'incertitude au seuil0,015

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,035
Tête enseignante GPT0,368
Écart entre enseignants0,333 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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