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Enregistrement W4414608321 · doi:10.22541/au.175915785.50500339/v1

Breeding for Disease Resistance with Minor Genes: Case Studies and Success Stories

2025· preprint· en· W4414608321 sur OpenAlexaff
Robert McGee, Marysia Zaleski-Cox, Barry L. Tillman, Owen Wally, Malini Jayawardana, W. G. Dilantha Fernando, Parveen Chhuneja, Harsh Raman, Harbans Bariana, Tanya Copley, Arron H. Carter, Valerio Hoyos‐Villegas

Notice bibliographique

Revuenon disponible
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant pathogens and resistance mechanisms
Établissements canadiensUniversity of ManitobaGrain Research CentreAgriculture and Agri-Food CanadaMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésDiseaseResistance (ecology)Minor (academic)Disease managementPlant disease resistance

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Among the established disease control strategies, host resistance plays a critical role in disease management across numerous host-pathogen systems. Research on minor genes is important to enhance disease resistance and to prolong effectiveness of major resistance (R) genes. Plant breeders often prefer to use R gene-mediated resistance due to the relatively simple means of introgressing R genes into breeding material using markers, whereas quantitative resistance (QR), though more complex to introduce, offers potentially more durable resistance. In this review, we highlight several case studies evaluating their objectives, the challenges they faced, and the progress they have made towards breeding with minor genes for QR. For blackleg (Leptosphaeria maculans) in canola (Brassica napus) and white mold (Sclerotinia sclerotiorum) in common bean (Phaseolus vulgaris), we detail the minor genes and quantitative trait loci (QTL) procedures used for their detection, general challenges when breeding with QR, and the developed germplasm sources Following this, we review notable success stories in breeding efforts for minor genes against stem rust, leaf rust, and stripe rust (Puccinia spp.) in wheat (Triticum aestivum), late leaf spot, early leaf spot, tomato and spotted wilt, and southern stem rot in peanut (Arachis hypogaea), as well as common bacterial blight in common bean. Finally, we evaluate emerging technologies and research avenues that could further accelerate progress in breeding for QR. Key advancements discussed include high-throughput phenotyping, phenomic selection, genomic selection, genome editing, traditional/classical pre-breeding, TILLING and EcoTILLING, and strategies leveraging pathogen population genetics and host-pathogen interactions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,006
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,008
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,031

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0060,008
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,002
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,043
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,225 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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