Various small mammal hosts are involved in the transmission cycle of zoonotic Anaplasma phagocytophilum in Southeastern Canada
Notice bibliographique
Résumé
Human granulocytic anaplasmosis (HGA) is a tick-borne disease emerging in North America, caused by the zoonotic variant Ap-ha (human active) of the bacterium Anaplasma phagocytophilum. This research aimed to understand the reservoir competency of small mammals for Ap-ha in the province of Québec, Canada. To achieve this aim, wild small mammals were sampled from June to August in 2022 and 2023 and tested for Ap and its variants (Ap-ha, Ap-v1) using qPCR targeting the msp2 and 16S genes. In total, 547 small mammals from nine different taxa were live captured across two years. Nearly half (48.2 %) of small mammals carried at least one Ixodes scapularis tick larva and 29.3 % carried at least one I. scapularis nymph. The odds of Ap infection were three times higher in eastern chipmunks (OR = 2.98, p < 0.05) and five times lower in red squirrels (OR = 0.21, p < 0.01) when compared to Peromyscus spp. mice. When infected, Peromyscus mice and eastern chipmunks transmitted the infection on average to 6.8 % (CI95: 24.9-48.7) and 52.9 % (CI95: 16.7-89.1) of feeding larvae, respectively. An Ap variant could be identified in 90 % (109/121) of infected small mammals, all of which were the Ap-ha strain. In conclusion, eastern chipmunks and Peromyscus mice should be considered as reservoir hosts contributing to the transmission and emergence of anaplasmosis in Canada. This study also confirms the circulation of the Ap-ha variant within host and tick communities in Southeastern Canada.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».