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Enregistrement W4414642547 · doi:10.1101/2025.09.28.679046

Atlantic cod (Gadus morhua) ecotypes, not inversion frequencies, underlie divergence in egg buoyancy distribution

2025· preprint· en· W4414642547 sur OpenAlexafffund
Rebecca Krohman, Simon Henriksson, Esben Moland Olsen, Halvor Knutsen, Rebekah A. Oomen

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMarine and fisheries research
Établissements canadiensUniversity of New Brunswick
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaMitacsMattilsynetFisheries Society of the British IslesNew Brunswick Innovation Foundation
Mots-clésEcotypeFjordBuoyancySalinityNeutral buoyancyTemperature salinity diagramsLocal adaptationMarine invertebrates

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Life-history divergence between Atlantic cod (Gadus morhua) ecotypes in Skagerrak is maintained despite gene flow. Fjord and North Sea ecotypes differ in growth, body size, and reproductive ecology. One environmental heterogeneity in Skagerrak is salinity, as coastal habitats experience substantially lower and more variable salinities than offshore waters. Egg buoyancy is highly sensitive to salinity and represents a critical life-history trait shaping survival and recruitment. Inversions on chromosomes 2, 7, and 12 in cod are linked to salinity adaptation and might be important for egg buoyancy and survival. Here, we conducted a buoyancy test on Atlantic cod eggs, spawned from North Sea and Fjord ecotypes, using Coombs apparatus. Genotypes for the inversions on chromosomes 2, 7, and 12 and ecotype were determined in all individuals (N=242). We hypothesized that individuals with different inversion genotypes and ecotypes would have divergent buoyancies. We found that buoyancy was variable and followed a bimodal distribution sorted by ecotype, with Fjord and North Sea individuals having mean buoyancies at neutral salinity (at 7°C) of 27 and 31 ppt, respectively. Therefore, individuals with intermediate buoyancies might be selected against. This finding is consistent with our expectations, as Fjord ecotypes experience lower salinities compared to North Sea ecotypes. Interestingly, there was little evidence that the inversions on chromosomes 2, 7, and 12 impacted buoyancy. Overall, we provide experimental evidence of the relative contributions of ecotypic background and inversions on a key life history trait, which helps to explain the maintained divergence among ecotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,221
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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