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Enregistrement W4414655438 · doi:10.1016/j.ajhg.2025.09.008

A cardiovascular, craniofacial, and neurodevelopmental disorder caused by loss-of-function variants in the eIF3 complex component genes EIF3A and EIF3B

2025· article· en· W4414655438 sur OpenAlexafffund
Esra Erkut, Cherith Somerville, M. Schwartz, Laura A. McDonald, Qiliang Ding, Olivia Moran, Xin Chen, Roozbeh Manshaei, Anne-Sophie Riedijk, Marie-Therese Schnürer, Daniel C. Koboldt, Stylianos E. Antonarakis, Emma Bedoukian, Xavier Blanc, Laura K. Conlin, Helen Cox, Karin E. M. Diderich, Bri Dingmann, Christèle Dubourg, Frances Elmslie, Luis Fernando González Escobar, Rachel Gosselin, María J. Guillen Sacoto, C Haag, Lisa Herzig, Ramanand Jeeneea, Priti Kenia, Konstantinos Kolokotronis, Anna M. Kopps, Hayley Lees, Jacqueline Leonard, Jonathan Levy, Rebecca O. Littlejohn, Scott McLean, Nikhil Pattani, Laurence Perrin, Véronique Pingault, Chloé Quēlin, Emmanuelle Ranza, Anita Rauch, Sara L. Reichert, Joana Rosmaninho‐Salgado, Cara Skraban, Sérgio Sousa, Melissa Stuebben, Paolo Zanoni, Raymond H. Kim, Ian C. Scott, Rebekah Jobling

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Human Genetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA regulation and disease
Établissements canadiensUniversity of CalgarySickKids FoundationTed Rogers Centre for Heart ResearchHospital for Sick Children
Organismes subventionnairesMedical Research CouncilUniversität ZürichAzrieli FoundationCanadian Institutes of Health ResearchNational Institute for Health and Care ResearchHeart of England NHS Foundation TrustCancer Research UKWellcome Trust
Mots-clésCraniofacialZebrafishGenePhenotypeRibosomal RNAMutationGenomeCandidate gene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Syndromic cardiac malformations can result in morbidity, yet their genetic etiology is only understood for a subset of individuals. Genome sequencing efforts in congenital anomaly cohorts may identify disease-associated variants in previously unrecognized genes. Through international matchmaking efforts, we identified eighteen individuals in total with de novo or loss-of-function variants in EIF3A (n = 4) or EIF3B (n = 14). The clinical phenotype varied but predominantly included cardiac defects, craniofacial dysmorphisms, mild developmental delays, and behavioral abnormalities. These genes encode core subunits of the eukaryotic initiation factor 3 (eIF3) complex, which plays a critical role in binding mRNA transcripts to the 40S ribosomal subunit during translation initiation. Both genes are highly constrained against loss of function, and animal models have demonstrated that disruptions in the eIF3 complex result in a range of developmental defects, including cardiovascular malformations. Additionally, EIF3B is located within the minimally overlapping region implicated in cardiac anomalies associated with 7p22.3 microdeletions. We sought to further study the role of these genes in syndromic congenital heart disease. To explore their functional impact, we generated zebrafish models with mutations in the orthologous eif3s10 and eif3ba genes, which resulted in developmental abnormalities, including thin heart tubes, lack of craniofacial cartilage, and embryonic lethality. We propose that pathogenic variants in EIF3A, as well as pathogenic variants or microdeletions involving EIF3B, cause a distinct autosomal-dominant neurodevelopmental syndrome characterized by cardiovascular and craniofacial manifestations.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,612
Score d'incertitude au seuil0,291

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,255
Écart entre enseignants0,243 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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