MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4414662296 · doi:10.22207/jpam.10.3.10

Occurrence and Characterization of Rhizoctonia spp., Causal Agents of Sheath Diseases Isolated from Rice in Lao PDR

2016· article· en· W4414662296 sur OpenAlexfundno aff
Pinkham Vongphachanh, Weerasak Saksirirat, Suwita Seapaisan

Notice bibliographique

RevueJournal of Pure and Applied Microbiology · 2016
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesAgricultural Biotechnology Research Center, Academia SinicaKhon Kaen UniversityInternational Development Research CentreSoutheast Asian Regional Center for Graduate Study and Research in Agriculture
Mots-clésRhizoctonia solaniMyceliumRhizoctoniaGenBankCultivarPathogenicityOrange (colour)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Sheath diseases of rice are major constraints to rice production in Asia. Collection of sheath disease samples were taken during the dry season (January-May), 2015 and the rainy season (June-November), 2016 from several fields in each of two provinces of Lao PDR. The pathogens were isolated and characterized on morphology, pathogenicity and molecular identification. Nineteen isolates of Rhizoctonia spp. were studied and found that seven isolates were R. solani and twelve isolates were R. oryzae. The R. solani mycelia on PDA were light brown to brown, sclerotia brown in color, globose to irregular shape. On other hand, R. oryzae mycelia on PDA were brown and orange brown, sclerotia were globose to irregular shape, dark brown or light-yellow color. Six isolates of Rhizoctonia with different characteristics were selected to identify using molecular technique. Molecular identification was carried out by PCR technique using primers, ITS5 (5’-GGAAGTAAAAGTCGTAACAAGG-3’) and ITS4 (5’-TCCTCCGCTT ATTGATATGC-3’) to amplify PCR products of ITS1-5.8S-ITS2 region of rRNA gene. The PCR products were about 750 base pairs and subjected to base sequence comparison in GenBank database. The result showed that isolates, SMN1-5, SMC1-2 and VNN were R. solani, while isolates VHN1-3, SMN1-7 and VHN were R. oryzae. Result on pathogenicity evaluation revealed that, the isolate VSV1-2 of R. oryzae which inoculated on a sheath produced the largest average lesion area of 303 mm2, compared to isolate SMN1-5 of R. solani with a result lesion area of 191 mm2. All 19 isolates were pathogenic to rice cultivar (Thadokham 8). The percent study indicates that the R. solani can invade both sheath and leaf of rice cultivar (Thadokham 8), however, R. oryzae invaded only on sheath. In addition, the occurrence and characterization of R. oryzae are reported for the first time in Lao PDR.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,902
Score d'incertitude au seuil0,109

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,201
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2016
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Pure and Applied MicrobiologyMême sujetPlant Disease Resistance and GeneticsTravaux en français237 207