A consensus immune dysregulation framework for sepsis and critical illnesses
Notice bibliographique
Résumé
Critical care syndromes such as sepsis, acute respiratory distress syndrome (ARDS) and trauma continue to have unacceptably high morbidity and mortality, with progress limited by the inherent heterogeneity within syndromic illnesses. Although numerous immune endotypes have been proposed for sepsis and critical care, the similarities and differences between these endotypes remain unclear, hindering clinical translation. The SUBSPACE consortium is an international consortium that aims to advance precision medicine in critical care through the sharing of transcriptomic data. Here, evaluating the overlap of existing immune endotypes in sepsis across >7,074 samples from 37 independent cohorts, we developed cell-type-specific gene expression signatures to quantify dysregulation within immune compartments. Myeloid and lymphoid dysregulation were associated with disease severity and mortality across all cohorts. Importantly, this dysregulation was also observed in patients with ARDS, trauma and burns, suggesting a conserved mechanism across various critical illness syndromes. Moreover, analysis of randomized controlled trial data revealed that myeloid and lymphoid dysregulation are associated with differential mortality in patients treated with anakinra in the SAVE-MORE trial (n = 452) and corticosteroids in the VICTAS (n = 89) and VANISH (n = 117) trials, underscoring their prognostic and therapeutic implications. In conclusion, our proposed immunology-based framework for quantifying cellular compartment dysregulation offers a potentially valuable tool for understanding immune dysregulation in critical illness with prognostic and therapeutic significance.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,016 | 0,009 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,002 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,002 | 0,002 |
| Bibliométrie | 0,005 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,009 |
| Communication savante | 0,005 | 0,004 |
| Science ouverte | 0,003 | 0,006 |
| Intégrité de la recherche | 0,003 | 0,010 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,002 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».