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Enregistrement W4414674860 · doi:10.1016/j.plaphy.2025.110574

Self-interaction pattern and targeted potential protein interaction networks of Arabidopsis CTP:phosphocholine cytidylyltransferase 1

2025· article· en· W4414674860 sur OpenAlexafffund
Qiong Xiao, Juli Wang, Guanqun Chen

Notice bibliographique

RevuePlant Physiology and Biochemistry · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsChina Scholarship CouncilCanada Foundation for Innovation
Mots-clésBimolecular fluorescence complementationArabidopsisArabidopsis thalianaProtein–protein interactionComplementationTwo-hybrid screeningMembrane proteinInteractomeGene isoform

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Phosphatidylcholine (PC) is a fundamental component of eukaryotic membranes, and its biosynthesis is tightly regulated to maintain membrane integrity and function. Despite the key role of CTP:phosphocholine cytidylyltransferase (CCT) in the rate-limiting step of PC synthesis, little is known about how CCT is modulated through protein-protein interactions (PPIs). In this study, we selected Arabidopsis thaliana CCT1 (AtCCT1) to investigate the potential regulatory network governing PC biosynthesis. Using yeast two-hybrid (Y2H) and bimolecular fluorescence complementation assays, we discovered that AtCCT1 forms self-association and interacts with its isoform AtCCT2. Importantly, AtCCT1 was also found to interact with importin α and β proteins, implying a potentially regulated transport mechanism. In addition, AtCCT1 and an Arabidopsis Sec14 family protein may also have interactions, which weakly activated reporter genes in the Y2H system but exhibited relatively stronger fluorescence in transformed tobacco leaf cells. Collectively, this study provides the first evidence of specific PPIs involving AtCCT1, offering new insight into the post-translational regulation of PC synthesis. These findings lay a foundation for future studies exploring how dynamic protein assemblies fine-tune membrane lipid metabolism, possibly in response to developmental or environmental conditions.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,632

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,003
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,195 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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