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Enregistrement W4414685281 · doi:10.1186/s43162-025-00514-w

Endoscopic ultrasound-guided biopsy for TB lymphadenopathy: role of PCR and Gene X-pert

2025· article· en· W4414685281 sur OpenAlexaff
Hussein Okasha, Rasha Mohamed Ahmed, Abeer Abdellatef, Mona Wassef, Hossam El‐Din Shaaban, Rasha Matar

Notice bibliographique

RevueThe Egyptian Journal of Internal Medicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiagnosis and treatment of tuberculosis
Établissements canadiensSt. Thomas Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMolecular diagnosticsPolymerase chain reactionMycobacterium tuberculosisBiopsyTuberculosisTuberculosis diagnosisMediastinal lymphadenopathyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Tuberculous lymphadenopathy presents a challenging diagnostic scenario, particularly in regions with high tuberculosis (TB) prevalence. Abdominal TB accounts for 10% of extrapulmonary TB cases. Diagnosing abdominal TB is difficult due to nonspecific clinical, radiological, and endoscopic findings. Blood and skin tests for TB exhibit variable sensitivities and specificities; therefore, histopathological diagnosis and molecular testing of tissue samples may provide greater accuracy than blood-based tests. Obtaining tissue samples under ultrasonographic or CT guidance can be difficult and risky, especially in intra-abdominal and mediastinal regions. Endoscopic ultrasound (EUS) and EUS-guided fine-needle biopsy (EUS-FNB) offer a safe technique for obtaining tissue samples for the diagnosis of abdominal and mediastinal TB. Comparative analyses of the Gene X-pert MTB/RIF assay and PCR techniques demonstrate nuanced diagnostic capabilities. Gene X-pert enables rapid molecular detection with high specificity for rifampicin resistance, whereas PCR facilitates molecular amplification of bacterial DNA. EUS provides the critical advantage of real-time imaging and precise tissue sampling. Several studies have found that EUS-FNB yields significantly higher diagnostic accuracy in complex TB presentations, with detection rates ranging from 78 to 92% across various anatomical sites. This review explores the diagnostic efficacy of molecular techniques, specifically polymerase chain reaction (PCR) and the Gene X-pert MTB/RIF assay, in detecting Mycobacterium tuberculosis in tissue samples obtained through EUS-FNB. Additionally, we evaluated the sensitivity, specificity, and rapid detection capabilities of these molecular methods compared to traditional diagnostic techniques. We further discussed whether molecular techniques such as PCR and Gene X-pert provide a powerful diagnostic strategy for TB lymphadenopathy in EUS-FNB tissue samples, thereby overcoming the limitations of conventional diagnostic methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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