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Enregistrement W4414685281 · doi:10.1186/s43162-025-00514-w

Endoscopic ultrasound-guided biopsy for TB lymphadenopathy: role of PCR and Gene X-pert

2025· article· en· W4414685281 sur OpenAlexaff
Hussein Okasha, Rasha Mohamed Ahmed, Abeer Abdellatef, Mona Wassef, Hossam El‐Din Shaaban, Rasha Matar

Notice bibliographique

RevueThe Egyptian Journal of Internal Medicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDiagnosis and treatment of tuberculosis
Établissements canadiensSt. Thomas Hospital
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMolecular diagnosticsPolymerase chain reactionMycobacterium tuberculosisBiopsyTuberculosisTuberculosis diagnosisMediastinal lymphadenopathyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Tuberculous lymphadenopathy presents a challenging diagnostic scenario, particularly in regions with high tuberculosis (TB) prevalence. Abdominal TB accounts for 10% of extrapulmonary TB cases. Diagnosing abdominal TB is difficult due to nonspecific clinical, radiological, and endoscopic findings. Blood and skin tests for TB exhibit variable sensitivities and specificities; therefore, histopathological diagnosis and molecular testing of tissue samples may provide greater accuracy than blood-based tests. Obtaining tissue samples under ultrasonographic or CT guidance can be difficult and risky, especially in intra-abdominal and mediastinal regions. Endoscopic ultrasound (EUS) and EUS-guided fine-needle biopsy (EUS-FNB) offer a safe technique for obtaining tissue samples for the diagnosis of abdominal and mediastinal TB. Comparative analyses of the Gene X-pert MTB/RIF assay and PCR techniques demonstrate nuanced diagnostic capabilities. Gene X-pert enables rapid molecular detection with high specificity for rifampicin resistance, whereas PCR facilitates molecular amplification of bacterial DNA. EUS provides the critical advantage of real-time imaging and precise tissue sampling. Several studies have found that EUS-FNB yields significantly higher diagnostic accuracy in complex TB presentations, with detection rates ranging from 78 to 92% across various anatomical sites. This review explores the diagnostic efficacy of molecular techniques, specifically polymerase chain reaction (PCR) and the Gene X-pert MTB/RIF assay, in detecting Mycobacterium tuberculosis in tissue samples obtained through EUS-FNB. Additionally, we evaluated the sensitivity, specificity, and rapid detection capabilities of these molecular methods compared to traditional diagnostic techniques. We further discussed whether molecular techniques such as PCR and Gene X-pert provide a powerful diagnostic strategy for TB lymphadenopathy in EUS-FNB tissue samples, thereby overcoming the limitations of conventional diagnostic methods.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,075
Score d'incertitude au seuil0,403

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,283 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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