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Enregistrement W4414690180 · doi:10.7554/elife.107082.1

The age and sex dynamics of heterosexual HIV transmission in Zambia: an HPTN 071 (PopART) phylogenetic and modelling study

2025· article· en· W4414690180 sur OpenAlexaff
Matthew Hall, William J. M. Probert, Lucie Abeler‐Dörner, Chris Wymant, Francesco Di Lauro, Xiayoue Xi, Rafael Sauter, Tanya Golubchik, David Bonsall, Michael Pickles, Anne Cori, Justin Bwalya, Sian Floyd, Nomtha Bell‐Mandla, Kwame Shanaube, Blia Yang, Peter Bock, Deborah Donnell, M. Kate Grabowski, Deenan Pillay, Andrew Rambaut, Oliver Ratmann, Sarah Fidler, Helen Ayles, Richard Hayes, Christophe Fraser

Notice bibliographique

RevueeLife · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHIV/AIDS Research and Interventions
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésTransmission (telecommunications)Context (archaeology)Incidence (geometry)Sexual transmissionPsychological interventionHuman immunodeficiency virus (HIV)Phylogenetic treeMen who have sex with men

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract While much progress has been made in reducing the incidence of HIV-1 infection in sub-Saharan Africa in recent years, bringing the epidemic to an end will require identification of the demographic groups that continue to contribute to transmission. Pathogen phylogenetics and individual-based mathematical models (IBMs) of transmission are approaches that enable researchers to explore such questions. Here, we used both methods to characterise the ages and sexes of the individuals involved in heterosexual transmission in the context of the HPTN 071 (PopART) trial in Zambia. The results were concordant, and show that the male partner was on average older than the female by less than seven years, with larger age gaps in male-to-female than female-to-male transmissions. We found that the largest gaps for female recipients were amongst the youngest of those recipients. Conversely, the youngest male recipients saw the smallest gaps. We further used the IBM to demonstrate that transmission to new age cohorts first entering into sexual activity is driven predominantly by male-to-female transmission. We also simulated the PopART universal testing and treatment intervention into the future to show that effective treatment of under-35-year-olds accounts for 93.8% of the reduction in incidence by 2039, while effective treatment of under-35-year-old men accounts for 62.1%. Finally, we simulated a one-year cessation of ART treatment for the whole population, which resulted in an immediate increase in the average age at transmission of both sources and recipients. With it becoming ever more expensive and difficult to find treatment-naive individuals and link them to care, targeted interventions for demographic groups such as under-35 men may be the key to finally ending HIV.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,004
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: Simulation ou modélisation
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,136
Score d'incertitude au seuil0,270

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,004
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,001
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,342
Écart entre enseignants0,315 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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