MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4414691310 · doi:10.1021/jacs.5c08730

Visualizing the Three-Dimensional Arrangement of Hydrogen Atoms in Organic Molecules by Coulomb Explosion Imaging

2025· article· en· W4414691310 sur OpenAlexaff
Alice E. Green, Keyu Chen, Surjendu Bhattacharyya, Felix Allum, Sergey Usenko, Michael N. R. Ashfold, T. Baumann, Kurtis Borne, M. Brouard, Michael Burt, Basile F. E. Curchod, Benjamin Erk, Ruaridh Forbes, Lea M. Ibele, Rebecca A. Ingle, Huynh Van Sa Lam, Xiang Li, Kang Lin, Tommaso Mazza, Joseph McManus, Michaël Meyer, Terry Mullins, J. Pedro F. Nunes, Daniel E. Rivas, Aljoscha Roerig, Arnaud Rouzée, Philipp Schmidt, John S. Searles, Björn Senfftleben, Henrik Stapelfeldt, Rico Mayro P. Tanyag, Florian Trinter, Anbu Selvam Venkatachalam, Enliang Wang, Emily M. Warne, Thomas Wolf, T. Jahnke, Artem Rudenko, Rebecca Boll, Daniel Rolles

Notice bibliographique

RevueJournal of the American Chemical Society · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineChemistry
ThématiqueMass Spectrometry Techniques and Applications
Établissements canadiensTrent University
Organismes subventionnairesHORIZON EUROPE Marie Sklodowska-Curie ActionsH2020 European Research CouncilBasic Energy SciencesEngineering and Physical Sciences Research CouncilLaboratoire d’excellence Physique Atomes Lumière MatièreDivision of PhysicsAgence Nationale de la RechercheHORIZON EUROPE Framework ProgrammeOffice of ScienceU.S. Department of EnergyEuropean CommissionDeutsche ForschungsgemeinschaftVillum FondenChemical Sciences, Geosciences, and Biosciences DivisionNational Science Foundation
Mots-clésCoulomb explosionFemtosecondMoleculeHydrogenAtom (system on chip)CoulombMolecular dynamicsMolecular orbitalCoupling (piping)

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Structure-sensitive methods based on femtosecond light or electron pulses are now making it possible to measure how molecular structures change during light-induced processes. Despite significant progress, high-fidelity imaging of nuclear positions remains a challenge even for relatively small molecular systems and, notably, regarding the positions of hydrogen atoms. As demonstrated in recent work, X-ray-induced Coulomb explosion imaging (CEI) may overcome this obstacle, as its sensitivity does not depend on the mass of the imaged atoms. The photoinduced ring opening of the heterocyclic molecule 2(5 H )-thiophenone has attracted recent interest. Here, we show that CEI offers a powerful route to imaging the peripheral H atoms in this molecule and thus, more generally, to tracking detailed nuclear motions (e.g., isomerizations) in organic molecules on ultrafast time scales. Specifically, we record momentum-space Coulomb explosion images that report on the three-dimensional positioning of all nuclei within the molecule, for instance, distinguishing H atoms in C–H bonds that lie within or are directed out of the plane defined by the heavy atoms. The prospect of imaging peripheral H atoms to probe photochemical dynamics is explored by coupling ab initio molecular dynamics with classical Coulomb explosion simulations, thereby differentiating potential photoproduct isomers, including those whose structures primarily differ in the position of the hydrogens.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,268
Écart entre enseignants0,262 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of the American Chemical SocietyMême sujetMass Spectrometry Techniques and ApplicationsTravaux en français237 207