20MO Hallmarks of gut health influence toxicity and survival outcomes after immune-checkpoint inhibitors
Notice bibliographique
Résumé
Background: Immune-related adverse events (irAEs) are side effects related to ICI, varying in severity, onset time and organ involvement.Recent studies showed the gut microbiome (GM) involvement in the risk of irAEs.In this study, we combined host and microbial metagenomics (MGS) to explore the influence of GM on treatment response and risk of irAEs.Methods: NCT04567446 provided MGS in patients (pts) with advanced non-small cell lung cancer, renal cell carcinoma and bladder cancer (n=613) treated with ICI alone (ICI cohort, n=529 pts) or in combination with chemotherapy (CT+ICI cohort, n=59) in France and Canada across the ClinicObiome project.Pts who experienced severe (≥ grade 3) irAEs after ICI+/-CT were compared to those who did not using microbial MGS parameters (diversity, PCoA and LEfSe).The host exfoliome (i.e., human reads in stool samples, estimated via MGS) association with overall survival (OS) using multivariate Cox regression models.Results: The GM of Pts with severe irAEs (13.3%) was less diverse and distinct compared to patients without severe irAEs (n=775 samples), before and during irAEs (n=125 samples), notably with an overrepresentation of several members of the Prevotellaceae family and Enterocloster spp.Interestingly, CT+ICI pts with severe irAEs had the most dysbiotic GM, characterized by a lower diversity and dominated by tolerogenic species.After the advent of irAE, the GM exhibits reduced diversity, with a distinct GM dominated by Prevotella spp, and a burst of Escherichia coli, a biomarker of inflammation.Prevotella copri B was associated to an increased overall survival of pts.Conclusions: Host-microbial interactions influence immunity and therefore ICI prognosis and irAEs.We found Prevotellaceae members as potential biomarkers for irAEs, as well as survival.The host exfoliome is an interesting parameter that may reflect gut fitness, requiring further investigation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,001 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,005 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».