Transcriptome of the human C2 dorsal root ganglia in C1–2 arthrodesis surgery: insight for neck pain
Notice bibliographique
Résumé
Neurons in the dorsal root ganglion (DRG) receive and transmit sensory information from the tissues they innervate and from the external environment. Upper cervical (C1-C2) DRGs are functionally unique as they receive input from the neck, head and occipital cranial dura, the latter two of which are also innervated by the trigeminal ganglion (TG). The C2 DRG also plays an important role in neck pain, a common and disabling disorder that is poorly understood. Advanced transcriptomic approaches have significantly improved our ability to characterize RNA expression patterns at single-cell resolution in the DRG and TG, but no previous studies have characterized the C2 DRG. Our aim was to use single-nucleus and spatial transcriptomic approaches to create a molecular map of C2 DRGs from patients undergoing arthrodesis surgery with ganglionectomy. Patients with acute (<3 months) or chronic (≥3 months) neck pain were enrolled and completed patient-reported outcome and somatosensory measures prior to surgery. C2 DRGs were characterized with bulk, single-nucleus and spatial RNA sequencing technologies from 22 patients. Through a comparative analysis to published datasets of the lumbar DRG and TG, neuronal clusters identified in both TG and DRG were identified in the C2 DRG. Therefore, our study characterizes the molecular composition of human C2 neurons and establishes their similarity with unique characteristics of subsets of TG neurons. We identified differentially expressed genes in endothelial, fibroblast and myelinating Schwann cells associated with chronic pain, including FGFBP2, C8orf34 and EFNA1, which have been identified in previous genome- and transcriptome-wide association studies. Our work provides the first characterization of the human C2 DRG and identifies altered gene expression patterns associated with chronic neck pain. This work establishes a foundation for the exploration of painful disorders in humans affecting the cervical spine.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».