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Enregistrement W4414716377 · doi:10.1016/j.gim.2025.101594

Toward ethical provenance tracking: The GA4GH model data access agreement (DAA)

2025· article· en· W4414716377 sur OpenAlexaff
Alexander Bernier, Bartha Maria Knoppers, Jonathan Lawson, Robyn McDougall, Maili Raven-Adams, Vasiliki Rahimzadeh

Notice bibliographique

RevueGenetics in Medicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueEthics in Clinical Research
Établissements canadiensMcGill UniversityLeukemia & Lymphoma Society of CanadaMcGill University Health CentreUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesNational Human Genome Research InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésData accessSoftwareCompliance (psychology)ProvenanceGenetic dataData Protection Act 1998Data model (GIS)Health Insurance Portability and Accountability ActHuman rights

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

PURPOSE: Standardizing contractual clauses that govern data access enables research institutions to responsibly steward genomic and related health data while enabling its efficient downstream reuse. METHODS: We describe a document analysis study using both qualitative and comparative law analytical approaches to identify the most common categories of clauses from 29 different data access agreements used by human biomedical research consortia globally. We furthermore characterized the legal positions and standard practices for each common element of the agreement and synthesized across them to develop model clauses. A total of 3 discussion sessions were organized virtually to refine the clauses among members of the Ethical Provenance Subgroup of the Global Alliance for Genomics and Health. RESULTS: We developed 15 unique data access clauses corresponding to the most common legal elements identified in the sampled agreements. CONCLUSION: Model clauses can be used to drive administrative efficiencies and institutional compliance for managing access to human genomic data for research. Additional machine-readable consents and software solutions are needed to support traceable "ethical provenance" of human genomic data and communicate data use conditions throughout the data's life-cycle.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,258
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,280
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMétarecherche, Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Théorique ou conceptuel · Signal consensuel: Théorique ou conceptuel
GenreSignal candidat: Méthodes · Signal consensuel: Méthodes
Score de désaccord entre enseignants0,994
Score d'incertitude au seuil0,915

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,2580,280
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0050,005
Études des sciences et des technologies0,0090,022
Communication savante0,0180,023
Science ouverte0,0040,014
Intégrité de la recherche0,0060,008
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,820
Tête enseignante GPT0,671
Écart entre enseignants0,149 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Devis d'étudeThéorique ou conceptuel
Domainenon disponible
GenreMéthodes

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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