A semi-selective differential medium for identifying strains of <i>Pantoea</i> from environmental samples
Notice bibliographique
Résumé
The genus Pantoea of the Erwinaceae is a genetically and metabolically diverse group whose representatives span a broad range of clinical and nonclinical environments. We sought to develop a culturing medium to facilitate the identification of Pantoea from environmental samples, and to distinguish its members from other closely related Gram-negative genera. We developed a semiselective differential medium, Pantoea Differential Medium (PDM), which contains crystal violet, sodium citrate, tryptone, as well as protease peptone. The efficacy of the medium was evaluated by assessing the growth and phenotype of 42 bacterial strains, including 18 strains of Pantoea along with other representatives of the Enterobacterales. All Pantoea strains, as well as Kosakonia sp. and Duffyella gerundensis formed orange-yellow pigmented colonies on the medium, while all other representative members of the Enterobacterales evaluated formed purple to pink colonies. The medium was also used to distinguish Pantoea from other bacteria in mixed cultures from environmental samples, with 44 of the 48 orange-yellow colonies being identified as members of Pantoea. PDM provides a means for rapidly identifying members of Pantoea from environmental samples, and differentiating them from many of the closely related members of the Erwiniaceae.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».