Microbial biodiversity of agricultural surface waters in Ontario, Canada
Notice bibliographique
Résumé
Understanding the microbial diversity is the first step to monitor the microbial quality of agricultural surface waters. Here we report a study comparing the microbial composition and diversities in agricultural surface waters in Ontario, Canada, including the streams adjacent to dairy cattle production in eastern Ontario and the field runoffs from the manure-impacted experimental farm of south-western Ontario. We also studied the quality of the surface water in the western basin of Lake Erie during a harmful algal bloom (cHAB). In eastern Ontario, we found significantly lower ( P < 0.01) abundance of Proteobacteria and Burkholderiales in the streams adjacent to dairy production than the non-agriculture site. Bacteroidetes was more abundant ( P < 0.0001) in medium/high order streams and agriculture/urban mixed site. Seasonal peaks of Flavobacterium were observed in low order streams but the trend was not in medium/high order streams. In south-western Ontario, the dominant bacterial taxa in field runoffs was Pseudomonas, regardless of manure types. We also discovered that the elevated total dissolved nitrogen, total dissolved phosphorus and chlorophyll a associated with the cHAB zone in Lake Erie was further away rather from the agricultural sites. In conclusion, our studies identified unique microbiome patterns associated with agricultural surface waters in Ontario.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,003 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».