MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4414757103 · doi:10.1101/2025.10.01.679797

Gene editing of <i>Nicotiana benthamiana</i> architecture for space-efficient production of recombinant proteins in controlled environments

2025· preprint· en· W4414757103 sur OpenAlexaff
Kristina LeBreux, Louis Feyzeau, Marie‐Claire Goulet, Charles Goulet, Dominique Michaud

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueTransgenic Plants and Applications
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMutantAxillary budGeneApical dominanceRecombinant DNAEnzymeMetabolic engineeringGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Indoor vertical farming (VF) offers several practical advantages for the cultivation of plant protein bio-factories, including plant uniformity, product consistency, water/nutrient recycling and production cycles on a year-round basis. Much progress has been achieved in recent years toward the development of innovative systems for artificial lighting, automated irrigation, plant handling, environment control and space use optimization in VF systems. Here, we used a CRISPR-Cas9 gene editing approach to generate mutant lines of transient protein expression host Nicotiana benthamiana presenting a compact, space-efficient phenotype compared to the so-called LAB strain commonly used for protein production. Our strategy consisted of altering apical dominance by suppressing the biosynthesis of strigolactone, a negative regulator of axillary bud outgrowth-promoting cytokinins. Strigolactone-depleted lines were generated by knocking-down the expression of either Carotenoid cleavage dioxygenase 7 (CCD7) or Carotenoid cleavage dioxygenase 8 (CCD8), two key enzymes of the metabolic pathway leading to strigolactone synthesis. Knocking-down the genes of either enzyme had no impact on the overall growth rate of the plant but drastically influenced its leaf proteome, auxin/cytokinin ratio and overall architecture. More specifically, the ΔCCD mutants exhibited altered glycolytic and malate-processing enzyme fluxes driving the production of pyruvate and cytokinins in leaf tissue, an axillary growth-oriented development pattern and, most importantly, a spatial footprint reduced by 45% to 50% compared to the LAB strain. Most importantly, recombinant protein yields per plant were maintained in the mutant lines, as here illustrated for the model protein GFP and for rituximab, a chimeric monoclonal antibody of confirmed clinical value in humans. Our data demonstrate the usefulness of ΔCCD7 and ΔCCD8 knockout leading to strigolactone depletion for the generation of compact, space-efficient N. benthamiana lines well suited to VF systems intended for biopharmaceutical production.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict)
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,208
Écart entre enseignants0,201 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory)Même sujetTransgenic Plants and ApplicationsTravaux en français237 207