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Enregistrement W4414779779 · doi:10.1038/s41598-025-18073-z

Estimation of reference curves for brain atrophy and analysis of robustness to machine effects

2025· article· en· W4414779779 sur OpenAlexaff
Elodie Piot, Félix Renard, Arnaud Attyé, Alexandre Krainik, Michael W. Weiner, Paul Aisen, Ronald Petersen, Clifford R. Jack, William Jagust, John Q. Trojanowki, Arthur W. Toga, Laurel Beckett, Robert C. Green, Andrew J. Saykin, John R. Morris, Leslie M. Shaw, Zaven S. Khachaturian, Greg Sorensen, Maria Carrillo, Lew Kuller, Marc Raichle, Steven M. Paul, Peter Davies, Howard Fillit, Franz Hefti, Davie Holtzman, M. Marcel Mesulam, William C. Potter, Peter J. Snyder, Tom Montine, Ronald G. Thomas, Michael Donohue, Sarah Walter, Tamie Sather, Gus Jiminez, Archana B. Balasubramanian, Jennifer Mason, Iris Sim, Danielle Harvey, Matt A. Bernstein, Nick C. Fox, Paul Thompson, Norbert Schuff, Charles DeCarli, Bret Borowski, Jeff Gunter, Matthew L. Senjem, Prashanthi Vemuri, David Jones, Kejal Kantarci, Chad Ward, Robert A. Koeppe, Norm Foster, Eric M. Reiman, Kewei Chen, Susan Landau, Nigel J. Cairns, Erin Householder, Lisa Taylor‐Reinwald, Virginia M.‐Y. Lee, Magdalena Korecka, Michal Figurski, Karen Crawford, Scott Neu, Tatiana M. Foroud, Steven Potkin, Li Shen, Kelley Faber, Sung Eun Kim, Lean Tha, R.T. Frank, John Hsiao, Jeffrey Kaye, Joseph F. Quinn, Lisa C. Silbert, Betty Lind, Raina Carter, Sara Dolen, Beau M. Ances, Maria Carroll, Mary L. Creech, Erin Franklin, Mark A. Mintun, Stacy Schneider, Angela Oliver, Lon S. Schneider, Sonia Pawluczyk, Mauricio Beccera, Liberty Teodoro, Bryan M. Spann, James Brewer, Helen Vanderswag, Daniel Marson, Randall Griffith, David G. Clark, David Geldmacher, John Brockington, Erik D. Roberson, Marissa Natelson Love, Judith L. Heidebrink, Joanne Lord, Sara S. Mason, Colleen S. Albers, David S. Knopman, Kris Johnson, Hillel Grossman, Effie Mitsis, Raj C. Shah, Leyla deToledo‐Morrell, Rachelle S. Doody, Javier Villanueva‐Meyer, Munir Chowdhury, Susan Rountree, Mimi Dang, Ranjan Duara, Daniel Varón, Maria T. Greig, Peggy Roberts, Yaakov Stern, Lawrence S. Honig, Karen L. Bell, Marilyn Albert, Chiadi U. Onyike, Daniel D’Agostino, Stephanie Kielb, James E. Galvin, Brittany Cerbone, Christina A. Michel, Dana M. Pogorelec, Henry Rusinek, Mony J. de Leon, Lidia Glodzik, Susan De Santi, Kyle Womack, Dana Mathews, Mary Quiceno, P. Murali Doraiswamy, Jeffrey R. Petrella, Salvador Borges‐Neto, Terence Z. Wong, Edward Coleman, Allan I. Levey, James J. Lah, Janet S. Cella, Jeffrey M. Burns, Russell H. Swerdlow, William M. Brooks, Steven E. Arnold, Jason H. Karlawish, David A. Wolk, Liana Apostolova, Kathleen Tingus, Ellen Woo, Daniel Silverman, Po H. Lu, George Bartzokis, Charles D. Smith, Gregory A. Jicha, P. Hardy, Partha Sinha, Elizabeth Oates, Gary Conrad, Neill R. Graff‐Radford, Francine Parfitt, Tracy Kendall, Heather Johnson, Oscar L. Lopez, MaryAnn Oakley, Donna M. Simpson, Martin R. Farlow, Ann Marie Hake, Brandy R. Matthews, Jared R. Brosch, Scott Herring, Cynthia Hunt, Anton P. Porsteinsson, Bonnie S. Goldstein, Kim Martin, Kelly M. Makino, M. Saleem Ismail, Connie Brand, Ruth A. Mulnard, Gaby Thai, Catherine Mc-Adams-Ortiz, Christopher H. van Dyck, Richard E. Carson, Martha G. MacAvoy, Pradeep Varma, Howard Chertkow, Howard Bergman, Chris Hosein, Sandra E. Black, Bojana Stefanovic, Curtis Caldwell, Ging‐Yuek Robin Hsiung, Howard J. Feldman, Benita Mudge, Michele Assaly, Elizabeth Finger, Stephen Pasternack, Irina Rachisky, Dick Trost, Andrew Kertesz, Charles Bernick, Donna Munic, Kristine Lipowski, Masandra Weintraub, Borna Bonakdarpour, Diana Kerwin, Chuang-Kuo Wu, Nancy Johnson, Carl Sadowsky, Teresa Villena, Raymond Scott Turner, Kathleen A. Johnson, Brigid Reynolds, Reisa A. Sperling, Keith A. Johnson, Gad Marshall, Jerome A. Yesavage, Joy L. Taylor, Barton Lane, Allyson Rosen, Jared Tinklenberg, Marwan N. Sabbagh, Christine M. Belden, Sandra A. Jacobson, Sherye A. Sirrel, Neil W. Kowall, Ronald Killiany, Andrew E. Budson, Alexander Norbash, Patricia Lynn Johnson, Thomas O. Obisesan, Saba Wolday, Joanne Allard, Alan J. Lerner, Paula Ogrocki, Curtis Tatsuoka, Parianne Fatica, Evan Fletcher, Pauline Maillard, John Olichney, Owen Carmichael, Smita Kittur, Michael Borrie, T.-Y. Lee, Robert Bartha, Sterling C. Johnson, Sanjay Asthana, Cynthia M. Carlsson, Adrian Preda, Dana Nguyen, Pierre N. Tariot, Anna Burke, Nadira Trncic, Stephanie Reeder, Vernice Bates, Horacio Capote, Michelle Rainka, Douglas W. Scharre, Maria Kataki, Anahita Adeli, Earl A. Zimmerman, Dzintra Celmins, Alice D. Brown, Godfrey D. Pearlson, Karen Blank, Karen Anderson, Laura A. Flashman, Marc Seltzer, Mary L. Hynes, Robert B. Santulli, Kaycee M. Sink, Leslie Gordineer, Jeff D. Williamson, Pradeep Garg, Franklin Watkins, Brian R. Ott, Henry Querfurth, Geoffrey Tremont, Stephen Salloway, Paul Malloy, Stephen Correia, Howard J. Rosen, Bruce L. Miller, David C. Perry, Jacobo Mintzer, Kenneth Spicer, David Bachman, Stephen Pasternak, Irina Rachinsky, John Rogers, Dick Drost, Nunzio Pomara, Raymundo Hernando, Antero Sarrael, Susan K. Schultz, Laura L. Boles Ponto, Hyungsub Shim, Karen Ekstam Smith, Norman Relkin, Gloria Chaing, Michael Lin, Lisa Ravdin, Amanda Smith, Balebail Ashok Raj, Kristin Fargher, Howard Rosen, Bradford C. Dickerson, Kimoko Domoto-Reilly, Bradley F. Boeve, Adam L. Boxer, John Kornak, William W. Seeley, Maria-Luisa Gorno-Tempini, Scott McGinnis, Maria Luisa Mandelli

Notice bibliographique

RevueScientific Reports · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueDementia and Cognitive Impairment Research
Établissements canadiensSt Joseph's Health CareSunnybrook Health Science CentreSt Joseph's Health CentreMcGill UniversityJewish General Hospital
Organismes subventionnairesNational Center for Research ResourcesNational Institute of Mental HealthNational Institute on AgingAssociation Nationale de la Recherche et de la TechnologieNorthern California Institute for Research and EducationNational Institutes of HealthAlzheimer's Disease Neuroimaging InitiativeEngineering and Physical Sciences Research CouncilUniversity of Southern California
Mots-clésRobustness (evolution)AtrophyHippocampal formationSegmentationPattern recognition (psychology)Neuroimaging

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Neurodegenerative diseases like Alzheimer's are difficult to diagnose due to brain complexity and imaging variability. However, volumetric analysis tools, using reference curves, help detect abnormal brain atrophy and support diagnosis and monitoring. This study evaluates the robustness of three segmentation algorithms, AssemblyNet, FastSurfer and FreeSurfer, in constructing brain volume reference curves and detecting hippocampal atrophy. Using data from 3,730 cognitively normal subjects, we built reference curves and assessed robustness to magnetic field strength (1.5T vs. 3T) using four error metrics (sMAPE, sMSPE, wMAPE, sMdAPE) with bootstrap validation. We evaluated classification performance using hippocampal atrophy rates and HAVAs scores (Hippocampal-Amygdalo-Ventricular Atrophy scores). AssemblyNet shows the lowest errors across all robustness metrics. In contrast, FastSurfer and FreeSurfer exhibit greater deviations, indicating higher sensitivity to field strength variability. AssemblyNet provides consistent hippocampal atrophy rates across all reference models, despite slightly lower sensitivity, while FastSurfer and FreeSurfer display greater variability. Specificity ranges from 0.87 to 0.91 for AssemblyNet, compared to 0.76-0.93 for FastSurfer and 0.86-0.93 for FreeSurfer. Using the HAVAs score, all methods detect high atrophy rates in Alzheimer's patients. FastSurfer achieves the highest sensitivity (0.98), while AssemblyNet reaches the best specificity (0.95) and the highest balanced accuracy (0.91). This study underscores the importance of algorithm choice for reliable brain volumetric analysis in heterogeneous imaging environments. Among the methods tested, AssemblyNet stands out as both sensitive to Alzheimer's-related atrophy and robust to acquisition variability, making it a strong candidate when analyzing hippocampal volumes in large, multi-site datasets.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,018
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,079
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Simulation ou modélisation · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: aucune
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,096

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0180,079
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,002
Bibliométrie0,0050,002
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0020,002
Science ouverte0,0010,002
Intégrité de la recherche0,0020,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,014
Tête enseignante GPT0,346
Écart entre enseignants0,332 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSimulation ou modélisation
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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