OS05.2.A DECIPHERING THE LONGITUDINAL TRAJECTORIES OF GLIOBLASTOMA ECOSYSTEMS BY INTEGRATIVE SINGLE-CELL GENOMICS
Notice bibliographique
Résumé
Abstract BACKGROUND The mechanisms governing the progression of IDH-wildtype glioblastoma (GBM) following standard-of-care therapy remain incompletely understood. While recurrence is nearly universal, the cellular and molecular trajectories that underpin this process - particularly the dynamics of tumor and microenvironmental compartments - have yet to be fully resolved. MATERIAL AND METHODS To dissect the longitudinal evolution of the GBM ecosystem, we analyzed paired primary and recurrent tumor specimens from 59 patients. We employed single-nucleus RNA sequencing to profile transcriptomic states at single-cell resolution and integrated these data with bulk DNA sequencing to assess genomic alterations. This approach enabled a comprehensive interrogation of cellular heterogeneity and malignant state transitions over time. RESULTS Across the cohort, the most consistent feature at recurrence was a decreased proportion of malignant cells, accompanied by a reciprocal expansion of non-malignant glial and neuronal cell populations within the tumor microenvironment (TME). While the dominant malignant cell state often differed between primary and recurrent samples, no state was uniquely associated with a specific disease stage. Moreover, no singular evolutionary trajectory characterized the cohort as a whole. Instead, subsets of patients exhibited enriched and partially convergent state transitions. Notably, shifts in malignant cell states were mirrored by concurrent remodeling of the TME, implicating a tightly interwoven pattern of tumor-microenvironment co-evolution. CONCLUSION These findings reveal diverse and patient-specific evolutionary trajectories in IDH-wildtype GBM, shaped by both therapeutic pressure and microenvironmental context. Our study provides a reference framework for understanding longitudinal GBM dynamics and highlights the importance of ecosystem-level interactions in driving recurrence.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,001 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».