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Enregistrement W4414809240 · doi:10.1093/genetics/iyag092

Regionally specific and highly pleiotropic loci together mediate skeletal evolution in tropical and temperate house mice

2025· article· en· W4414809240 sur OpenAlexaff
Sylvia M. Durkin, Kathleen G. Ferris, Mallory A. Ballinger, Ke Bi, Gabriela Heyer, Michael W. Nachman

Notice bibliographique

RevueGenetics · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueBat Biology and Ecology Studies
Établissements canadiensUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational Institutes of HealthNational Science Foundation
Mots-clésQuantitative trait locusTemperate climatePopulationHouse miceLocus (genetics)House mouseGenetic architecturePhenotype

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract When organisms are exposed to new environments, they often evolve a suite of adaptive phenotypic changes. Understanding the genetic basis of these changes gives us insight into the factors that constrain and facilitate the process of adaptation. Here we use quantitative trait locus (QTL) mapping in wild-derived house mice from temperate and tropical environments to describe the genetic architecture of adaptive skeletal evolution. This study provides a unique view into the evolution of discordant phenotypic changes within the interconnected skeletal system, since tropical and temperate mice have evolved under the opposing forces of Allen’s and Bergmann’s rules (shorter extremities, but larger body size in cold climates). We generated an F3 mapping population of 449 mice and measured a variety of cranial and post-cranial skeletal traits. First, we discovered that temperate and tropical house mice have undergone extensive skeletal divergence in accordance with Allen’s and Bergmann’s rules. Warm-adapted mice have longer limbs, longer pelvic girdles, longer and narrower skulls, but smaller overall body size. Second, we identified 83 QTL across 13 traits and found that the genetic basis of skeletal divergence involved mainly additive, small-effect loci distributed across the genome. While most QTL influenced only one or two traits, we also identified several highly pleiotropic QTL that influenced multiple traits across the skeletal system, often antagonistically to the evolved difference. Such pleiotropic loci may constrain adaptation. Lastly, we found that QTL for overall skeletal variation were enriched for signatures of selection in wild house mouse populations, providing evidence that skeletal variation in this system is indeed driven by adaptive evolution. Article Summary The incredible diversity of the vertebrate skeleton offers an opportunity to explore the genetic architecture of phenotypic variation, which is essential to understanding the process of evolution. We characterize the genetic basis of morphological evolution using QTL mapping in house mice adapted to differing climates. Skeletal divergence is widespread in these mice and reflects temperature adaptation. This divergence is mediated by small-effect loci scattered across the genome, as well as several highly-pleiotropic loci. Interestingly, pleiotropic loci often influence phenotypes in the opposite direction from the evolved change, perhaps constraining the process of adaptation. This work demonstrates how complex morphological changes can evolve within an interconnected system, such as the skeleton, under functional, developmental, and selective constraints.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,043
Score d'incertitude au seuil0,170

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,206
Écart entre enseignants0,194 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
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Résumé présentoui

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