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Enregistrement W4414831158 · doi:10.1093/jas/skaf300.461

PSV-10 Genetic parameters of disease in growing pigs under a polymicrobial natural disease challenge.

2025· article· en· W4414831158 sur OpenAlexaffabout
Usamah Kabuye, John C. S. Harding, Michael K. Dyck, Frédéric Fortin, Graham Plastow, Tom Rathje, Jack C. M. Dekkers

Notice bibliographique

RevueJournal of Animal Science · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic and phenotypic traits in livestock
Établissements canadiensCentre de Développement du Porc du QuébecUniversity of AlbertaUniversity of Saskatchewan
Organismes subventionnairesNational Institute of Food and AgricultureU.S. Department of Agriculture
Mots-clésHeritabilityDiseaseGenetic correlationLitterAnimal modelOutbreakFlockGenetic variation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract This study aimed to estimate genetic parameters of disease-related traits of growing pigs exposed to a natural polymicrobial disease challenge. The challenge was established by introducing seeder pigs into a wean to finish research facility and maintained by introducing a new batch of 60 or 75, ~40 day old clinically healthy Yorkshire x Landrace barrows into the challenge nursery (cNur) every 3 weeks, with a 1-week overlap with the previous batch, before the latter was moved to the finisher (FIN). Data used included individual health treatment(s) and mortality records on 4095 barrows from 7 breeding companies. Traits analyzed included treatment rates (TRR) and mortalities (MOR), categorized as meningitis (ME), respiratory distress (RD), scours (SC), unthrifty (UNTH), and other infections (OT). Analyses were by generalized and linear mixed models with genomic relationships. Heritability estimates for TRR and MOR were generally higher in cNur than in FIN. Compared to other disease categories, RD tended to have higher heritability estimates both in cNur (TRR-RD: 0.14±0.03, MOR-RD: 0.09±0.08) and FIN (TRR-RD: 0.07±0.03, MOR-RD: 0.18±0.09). Litter effects were generally low both in cNur and Fin but stronger in cNur (TRR-RD: 0.04±0.02, MOR-UNTH: 0.05±0.02). For RD, genetic correlation estimates among TRR and MOR in cNur and FIN were generally positive ranging from 0.40±0.18 for cNur TRR with FIN MOR to 0.95±0.30 for cNur MOR with FIN MOR. Corresponding genetic correlation estimates for other disease categories were either moderately negative (-0.19±0.32 for OT TRR between cNur and FIN), not positive definite, or the model did not converge. This study considered both TRR and MOR for different disease categories and growth phases for a large number of pigs under a severe natural polymicrobial disease challenge and provides valuable information to breed for disease resilience. Funding from Genome Canada, Genome Alberta, Genome Prairie, PigGen Canada, USDA NIFA (2017-67007-26144) and the National Pork Board Survivability Project.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,261
Écart entre enseignants0,252 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
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