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Enregistrement W4414842277 · doi:10.1101/2025.10.03.680381

A noncanonical TNL immune hub defines separable recognition and signaling modules for clubroot resistance

2025· preprint· en· W4414842277 sur OpenAlexafffund
Hao Hu, Fengqun Yu

Notice bibliographique

RevuebioRxiv (Cold Spring Harbor Laboratory) · 2025
Typepreprint
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésJasmonic acidPlant ImmunityImmune systemSystemic acquired resistanceClubrootGenePlant disease resistanceElicitorImmunityTranscriptome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Plant immunity mediated by nucleotide-binding leucine-rich repeat (NLR) receptors often relies on canonical EDS1 / NDR1 signaling, but alternative mechanisms are emerging. We uncover a novel modular, noncanonical immune hub orchestrated by Rcr1 , a TIR-NLR (TNL) gene conferring clubroot resistance in Brassica napus against the root-infecting protist Plasmodiophora brassicae . Unlike typical TNLs, Rcr1 engages non-NLR partners in two separable modules: a CP1 (cysteine protease)–WRKY-based recognition module, likely monitoring a pathogen virulence target, and an AP (ankyrin-repeat protein)–ERF-based signaling module, driving jasmonic acid/ethylene-mediated defense. This architecture functions without detectable EDS1 / NDR1 involvement, challenging salicylic acid-dominant models of biotrophic immunity and expanding current views of how TNLs can be wired in plant defense. Using high-throughput interactor screening and CRISPR/Cas9 knockouts, we validate these modules, while heat-inducible gene excision reveals Rcr1 ’s critical early role (0–14 days post-inoculation). Together, our findings position Rcr1 as an exemplar of modular TNL architecture, suggesting that separable recognition and signaling branches may represent a broader principle of immune flexibility in plants. This study redefines TNL flexibility, offering a blueprint for breeding durable disease-resistant crops via modular immune engineering, with clubroot resistance as a model.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,024
Tête enseignante GPT0,216
Écart entre enseignants0,193 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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