MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4414891572 · doi:10.5858/arpa.2025-0074-oa

Clinicopathologic Features and Genomic Profile of Human Epidermal Growth Factor Receptor 2–Low and Human Epidermal Growth Factor Receptor 2–Ultralow Invasive Breast Carcinomas

2025· article· en· W4414891572 sur OpenAlexaff
Harpreet Rai, Elzbieta Slodkowska, Sharon Nofech‐Mozes, Anna Plotkin, Fang-I Lu

Notice bibliographique

RevueArchives of Pathology & Laboratory Medicine · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHER2/EGFR in Cancer Research
Établissements canadiensLakeridge HealthSunnybrook Health Science CentreSt. Joseph’s Healthcare Hamilton
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésImmunohistochemistryEpidermal growth factor receptorHuman Epidermal Growth Factor Receptor 2Hormone receptorReceptorHormoneEpidermal growth factorBreast cancer

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Context.—: Recent clinical trials have identified significant benefits of human epidermal growth factor receptor 2 (HER2)-targeting antibody conjugates in invasive breast carcinomas with HER2-low and HER2-ultralow expression, challenging the conventional binary HER2 status. Objective.—: To examine the clinicopathologic features and genomic profile of HER2-low and HER2-ultralow invasive breast carcinomas. Design.—: Two hundred thirteen cases were identified with HER2 immunohistochemistry (IHC) reported as 0, 1+, and 2+/in situ hybridization-negative with Oncotype DX results from 2017-2022. One hundred seventy-eight cases with hematoxylin-eosin and HER2 slides available were independently scored by 5 pathologists blinded to the reported HER2 results as HER2 0, 0-1, 1+, and 2+, using light microscopy. For each HER2 IHC score, patient age, tumor characteristics, and HER2 mRNA expression scores were compared. Additionally, each hormone receptor IHC score was compared to its respective mRNA expression scores. Results.—: The overall interobserver agreement of HER2 IHC scoring was substantial, with a κ value of 0.689 (0.658-0.710; P < .001). There was no statistically significant difference in age and tumor characteristics by HER2 IHC scores. HER2 IHC scores were significantly associated with median HER2 mRNA expression scores (P < .001). However, for all 3 biomarkers, significant overlaps in mRNA expression scores existed between the different IHC scores. Conclusions.—: In our study, there were no significant differences in clinicopathologic features among HER2 IHC scores. In addition, there was considerable overlap in HER2 and hormone receptor mRNA scores across different IHC categories, limiting their utility as predictors of HER2 and hormone receptor IHC scores.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,003
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,006

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,003
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,331
Écart entre enseignants0,303 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueArchives of Pathology & Laboratory MedicineMême sujetHER2/EGFR in Cancer ResearchTravaux en français237 207