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Enregistrement W4414902674 · doi:10.1094/pdis-05-25-0942-re

Diversity, Virulence, and Fungicide Sensitivity of <i>Colletotrichum</i> Species Associated with Apple Bitter Rot in Nova Scotia

2025· article· en· W4414902674 sur OpenAlexafffundabout
Michael S. McLaughlin, Pervaiz A. Abbasi, Shawkat Ali

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePlant Pathogens and Fungal Diseases
Établissements canadiensNova Scotia Department of AgricultureAgriculture and Agri-Food CanadaDalhousie University
Organismes subventionnairesAgriculture and Agri-Food Canada
Mots-clésFungicideFludioxonilColletotrichumNova scotiaFruit rotPathogenicity

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

To date, 21 distinct Colletotrichum species have been identified as causal agents of bitter rot on apple fruit. However, whereas bitter rot occurs in nearly all apple-growing regions, the Colletotrichum species responsible for this disease are not globally prevalent and have distinct regional distributions. Because Colletotrichum species can differ in pathogenicity, virulence, and fungicide sensitivities, characterizing the species present in a growing region is essential for effective disease management. In this study, we obtained 130 Colletotrichum isolates from symptomatic fruit collected in five apple orchards in Nova Scotia and one in New Brunswick, Canada. Using morphological characteristics and multilocus phylogenetic analysis of beta tubulin, internal transcribed spacer, glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase, actin, and chitin synthase 1, we identified three Colletotrichum species: C. fioriniae (97.6% of isolates), C. salicis (1.5%), and C. nymphaeae (0.8%). We observed that C. salicis was the most aggressive species on detached ‘Honeycrisp’ apple fruit. The in vitro fungicide sensitivity assays revealed that C. nymphaeae was significantly less sensitive to thiabendazole and difenoconazole than the other two species. For C. fioriniae, pyraclostrobin was the most effective fungicide in vitro, followed by difenoconazole, fludioxonil, and thiabendazole. Taken together, these findings provide critical insights for managing bitter rot in Nova Scotia and underscore the need for ongoing monitoring of Colletotrichum species prevalence to inform control strategies effectively.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,382
Score d'incertitude au seuil0,769

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0010,001
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,198
Écart entre enseignants0,189 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2025
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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