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Enregistrement W4414908046 · doi:10.1186/s13567-025-01605-w

Effects of glucocorticoid receptor activation on gene expression and antiviral responses in Atlantic salmon (Salmo salar L.) red blood cells

2025· article· en· W4414908046 sur OpenAlexaff
Thomais Tsoulia, Marit Måsøy Amundsen, Martine Johansen Aardal, Ma Jesús Francés Mira, Frieda Betty Ploss, Randi Faller, Ingvill Jensen, Mona C. Gjessing, Colin J. Brauner, Maria K. Dahle

Notice bibliographique

RevueVeterinary Research · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAquaculture disease management and microbiota
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesNorges ForskningsrådUniversitetet i OsloNational Science Council
Mots-clésGlucocorticoid receptorDownregulation and upregulationGene expressionGlucocorticoidTranscriptomeEx vivoGeneReceptorAgonist

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Farmed Atlantic salmon are subjected to different stressors during management routines, leading to prolonged elevated cortisol levels in the blood, a hallmark of chronic stress responses. In this study, we investigate how dexamethasone, an agonist for glucocorticoid receptors (GRs), and cortisol, an endogenous glucocorticoid, regulate gene expression in isolated A. salmon red blood cells (RBCs). Salmonid RBCs express GR genes at high levels. Transcriptional analysis revealed that dexamethasone significantly upregulated 156 genes, and led to > 100-fold induction of the genes FKBP prolyl isomerase 5 (fkbp5), the Krueppel-like factor 9 (klf9), and the DNA damage-inducible transcript 4 (ddit4). The significant upregulation of fkbp5 persisted for up to two weeks post RBC stimulation, indicating its potential as a biomarker candidate for chronic stress exposure. We compared ex vivo transcriptional responses in RBCs with responses in blood cells from A. salmon injected intraperitoneally with hydrocortisone, and found that ddit4 may be the most promising biomarker candidate for stress response in vivo. Dexamethasone and cortisol also downregulated antiviral and proteasome genes triggered by double-stranded RNA in RBCs. The results indicate that glucocorticoids have a profound effect on gene expression and putatively alter functions of A. salmon RBCs, and particularly block the antiviral response.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,029
Score d'incertitude au seuil0,539

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,308
Écart entre enseignants0,285 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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