Effects of glucocorticoid receptor activation on gene expression and antiviral responses in Atlantic salmon (Salmo salar L.) red blood cells
Notice bibliographique
Résumé
Farmed Atlantic salmon are subjected to different stressors during management routines, leading to prolonged elevated cortisol levels in the blood, a hallmark of chronic stress responses. In this study, we investigate how dexamethasone, an agonist for glucocorticoid receptors (GRs), and cortisol, an endogenous glucocorticoid, regulate gene expression in isolated A. salmon red blood cells (RBCs). Salmonid RBCs express GR genes at high levels. Transcriptional analysis revealed that dexamethasone significantly upregulated 156 genes, and led to > 100-fold induction of the genes FKBP prolyl isomerase 5 (fkbp5), the Krueppel-like factor 9 (klf9), and the DNA damage-inducible transcript 4 (ddit4). The significant upregulation of fkbp5 persisted for up to two weeks post RBC stimulation, indicating its potential as a biomarker candidate for chronic stress exposure. We compared ex vivo transcriptional responses in RBCs with responses in blood cells from A. salmon injected intraperitoneally with hydrocortisone, and found that ddit4 may be the most promising biomarker candidate for stress response in vivo. Dexamethasone and cortisol also downregulated antiviral and proteasome genes triggered by double-stranded RNA in RBCs. The results indicate that glucocorticoids have a profound effect on gene expression and putatively alter functions of A. salmon RBCs, and particularly block the antiviral response.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».