MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W4414908562 · doi:10.1172/jci.insight.191220

Faithful modeling of terminal CD8+T cell dysfunction and epigenetic stabilization in vitro

2025· article· en· W4414908562 sur OpenAlexaff
Amir Yousif, Abbey A. Saadey, Ava Lowin, Ankita Saini, Madeline R. Allison, Kelley Ptak, Eugene M. Oltz, Hazem E. Ghoneim

Notice bibliographique

RevueJCI Insight · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensInstitute of Infection and Immunity
Organismes subventionnairesNational Institute of Allergy and Infectious DiseasesNational Institute on Drug AbuseNational Cancer InstituteNational Heart, Lung, and Blood InstituteNational Institutes of Health
Mots-clésEpigeneticsLymphocytic choriomeningitisCellIn vitroAdoptive cell transferIn vivoTranscriptomeImmune checkpointT cellImmune system

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Epigenetic scarring of terminally dysfunctional (TDysf) CD8+ T cells hinders long-term protection and response to immune checkpoint blockade during chronic infections and cancer. We developed a faithful in vitro model for CD8+ T cell terminal dysfunction as a platform to advance T cell immunotherapy. Using TCR-transgenic CD8+ T cells, we found that 1-week peptide stimulation, mimicking conditions in previous models, failed to induce a stable exhaustion program. In contrast, prolonged stimulation for 2-3 weeks induced T cell dysfunction but triggered activation-induced cell death, precluding long-term investigation of exhaustion programs. To better mimic in vivo exhaustion, we provided post-effector, chronic TGF-β1 signals, enabling survival of chronically stimulated CD8+ T cells for over 3 weeks. These conditions induced a state of terminal dysfunction, marked by a stable loss of effector, cytotoxicity, and memory programs, along with mitochondrial stress and impaired protein translation. Importantly, transcriptomic and epigenetic analyses verified the development of terminal exhaustion-specific signatures in TDysf cells. Adoptive transfer of TDysf cells revealed their inability to recall effector functions or proliferate after acute lymphocytic choriomeningitis virus rechallenge. This tractable model system enables investigation of molecular pathways driving T cell terminal dysfunction and discovery of therapeutic targets for cancer or chronic infections.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,042
Score d'incertitude au seuil0,356

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,009
Tête enseignante GPT0,236
Écart entre enseignants0,228 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2025
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJCI InsightMême sujetEpigenetics and DNA MethylationTravaux en français237 207