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Enregistrement W4414939023 · doi:10.1016/j.lwt.2025.118597

Novel antimicrobial compounds from fermented food-derived Lacticaseibacillus paracasei B1 and Lactiplantibacillus plantarum O24 strains: Genomic and proteomic analysis

2025· article· en· W4414939023 sur OpenAlexafffund
Marcelina Karbowiak, Michał Wójcicki, Jae‐Eun Hyun, Piotr Szymański, Yandong Niu, Dorota Zielińska

Notice bibliographique

RevueLWT · 2025
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiqueProbiotics and Fermented Foods
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaFaculty of Veterinary Medicine, University of CalgaryPolska Akademia Nauk
Mots-clésFermentationAntimicrobialLactobacillus paracaseiFermentation in food processing

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

This study investigated the genomic and functional characteristics of antimicrobial compounds produced by Lacticaseibacillus paracasei strain B1 and Lactiplantibacillus plantarum strain O24, previously isolated from traditional Polish fermented foods. Whole-genome sequencing and bioinformatics analyses revealed multiple gene regions encoding bacteriocins, including lactococcins, plantaricins, and enterolysin A, with genes on both chromosomes and plasmids. Experimental validation confirmed the proteinaceous nature of the active antimicrobial substances, as evidenced by their sensitivity to proteolytic enzymes (trypsin, pepsin, and proteinase K) and their stability under heat (40–100 °C) and acidic pH conditions. Antimicrobial activity was observed against Gram-positive and Gram-negative bacteria, significantly inhibiting Listeria monocytogenes and Escherichia coli O157:H7. Fourier-Transform Infrared (FT-IR) spectroscopy assessed functional groups and active sites. Purification and molecular weight estimation via SDS-PAGE analysis identified protein bands of approximately 15 kDa and 10 kDa. LC-MS/MS analysis confirmed these results and indicated partial homology with previously reported bacteriocins, suggesting they may represent novel bacteriocins or bacteriocin-like inhibitory substances. These findings highlight the potential of food-origin lactic acid bacteria strains as a source of diverse and robust antimicrobial compounds, paving the way for food preservation and antimicrobial therapy applications.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,937
Score d'incertitude au seuil0,509

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,015
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,197 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations4
Publié2025
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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