Novel antimicrobial compounds from fermented food-derived Lacticaseibacillus paracasei B1 and Lactiplantibacillus plantarum O24 strains: Genomic and proteomic analysis
Notice bibliographique
Résumé
This study investigated the genomic and functional characteristics of antimicrobial compounds produced by Lacticaseibacillus paracasei strain B1 and Lactiplantibacillus plantarum strain O24, previously isolated from traditional Polish fermented foods. Whole-genome sequencing and bioinformatics analyses revealed multiple gene regions encoding bacteriocins, including lactococcins, plantaricins, and enterolysin A, with genes on both chromosomes and plasmids. Experimental validation confirmed the proteinaceous nature of the active antimicrobial substances, as evidenced by their sensitivity to proteolytic enzymes (trypsin, pepsin, and proteinase K) and their stability under heat (40–100 °C) and acidic pH conditions. Antimicrobial activity was observed against Gram-positive and Gram-negative bacteria, significantly inhibiting Listeria monocytogenes and Escherichia coli O157:H7. Fourier-Transform Infrared (FT-IR) spectroscopy assessed functional groups and active sites. Purification and molecular weight estimation via SDS-PAGE analysis identified protein bands of approximately 15 kDa and 10 kDa. LC-MS/MS analysis confirmed these results and indicated partial homology with previously reported bacteriocins, suggesting they may represent novel bacteriocins or bacteriocin-like inhibitory substances. These findings highlight the potential of food-origin lactic acid bacteria strains as a source of diverse and robust antimicrobial compounds, paving the way for food preservation and antimicrobial therapy applications.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».